Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NF1_0015100
Sequence Length
1521 nt
GC Content
0.4392
AAGUUAUUUCUGGACAGUCUACGAAAAGCUCUUGCUGGCCAUGGAGGAAGUAGGCAGCUGACAGAAAGUGCUGCAAUUGCCUGUGUCAAACUGUGUAAAGCAAGUACUUACAUCAAUUGGGAAGAUAACUCUGUCAUUUUCCUACUUGUUCAGUCCAUGGUGGUUGAUCUUAAGAACCUGCUUUUUAAUCCAAGUAAGCCAUUCUCAAGAGGCAGUCAGCCUGCAGAUGUGGAUCUAAUGAUUGACUGCCUUGUUUCUUGCUUUCGUAUAAGCCCUCACAACAACCAACACUUUAAGAUCUGCCUGGCUCAGAAUUCACCUUCUACAUUUCACUAUGUGCUGGUAAAUUCACUCCAUCGAAUCAUCACCAAUUCCGCAUUGGAUUGGUGGCCUAAGAUUGAUGCUGUGUAUUGUCACUCGGUUGAACUUCGAAAUAUGUUUGGUGAAACACUUCAUAAAGCAGUGCAAGGUUGUGGAGCACACCCAGCAAUACGAAUGGCACCGAGUCUUACAUUUAAAGAAAAAGUAACAAGCCUUAAAUUUAAAGAAAAACCUACAGACCUGGAGACAAGAAGCUAUAAGUAUCUUCUCUUGUCCAUGGUGAAACUAAUUCAUGCAGAUCCAAAGCUCUUGCUUUGUAAUCCAAGAAAACAGGGGCCCGAAACCCAAGGCAGUACAGCAGAAUUAAUUACAGGGCUCGUCCAACUGGUCCCUCAGUCACACAUGCCAGAGAUUGCUCAGGAAGCAAUGGAGGCUCUGCUGGUUCUUCAUCAGUUAGAUAGCAUUGAUUUGUGGAAUCCUGAUGCUCCUGUAGAAACAUUUUGGGAGAUUAGCUCACAAAUGCUUUUUUACAUCUGCAAGAAAUUAACUAGUCAUCAAAUGCUUAGUAGCACAGAAAUUCUCAAGUGGUUGCGGGAAAUAUUGAUCUGCAGGAAUAAAUUUCUUCUUAAAAAUAAGCAGGCAGAUAGAAGUUCCUGUCACUUUCUCCUUUUUUACGGGGUAGGAUGUGAUAUUCCUUCUAGUGGAAAUACCAGUCAAAUGUCCAUGGAUCAUGAAGAAUUACUACGUACUCCUGGAGCCUCUCUCCGGAAGGGAAAAGGGAACUCCUCUAUGGAUAGUGCAGCAGGAUGCAGCGGAACCCCCCCGAUUUGCCGACAAGCCCAGACCAAACUAGAAGUGGCCCUGUACAUGUUUCUGUGGAACCCUGACACUGAAGCUGUUCUGGUUGCCAUGUCCUGUUUCCGCCACCUCUGUGAGGAAGCAGAUAUCCGGUGUGGGGUGGAUGAAGUGUCAGUGCAUAACCUCUUGCCCAACUAUAACACAUUCAUGGAGUUUGCCUCUGUCAGCAAUAUGAUGUCAACAGGAAGAGCAGCACUUCAGAAAAGAGUGAUGGCACUGCUGAGGCGCAUUGAGCAUCCCACUGCAGGAAACACUGAGGCUUGGGAAGAUACACAUGCAAAAUGGGAACAAGCAACAAAGCUAAUCCUUAACUAUCCAAAAGCCAAAAUGGAAGAUGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-418.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -449.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((((((...)))).))))....))).((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))).)).))))))).((.....))..........))))))).)).))))))(.((((((((((((((((((.((((.((((...((((............))))..)))).))))(((((((((.(...((((....))))...).)))))))))((((.....((((......))))....))))))))))..........(((((((((.((..(((((.(((..(.((((......)))))..))).)))))..((((.(((((((((((((((((......))))))))))(((..(((((((.(((((((((((((((((((.(...((((.....(((((.(((((....))))).))))).(((..(((.(((...))))))..)))...))))...))))))))......((((((....(((........)))...)))))).............(((((((.(..(((((.((....)).)))))..).)))).)))........(((.((..(((.((((((....))))))..))))).)))....(((........)))..))))))))).))).)))))))..)))(((.(((.(((((((...((((.((.....(((....((((((.....))))))...)))..))))))......))))))).))))))..))))))))))).(((((....((((((((...(((((.((((((((((........(((............))).........))))))......((((....)))).......))))))))).))))))))............))))).....................)))))))))))(((((....((((((.((((((((......)))).)))).))))))...)))))(.(((.....))).).......))))))))..)))).)............((((....(((.((....)).)))....))))..)))))).((((((((.....(((((..(((((....))((((.(((((...(((((((((.........((.(((((((...(((.(((((.(((.........))).))))))))...))..))))).))((((((((..(((....))).))))))))...(((.((((((((((..(((.((((((((((.....(((((................(((.((((((((((((((((..(((......)))..))))..)).)))).)))))))))))))).....)))))).....)))).)))..)))))))).)).)))....))).)))))).............))))).)))).............))).)))))..))))))))....(((...)))...))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...{(((((({...|}}}.}}}}.|,.}}}.((((((((((((,(((((((.((.((((((((((((((((..(((((.((.....)).).)))}.)),})))))).,,,,...,|.,..,,,...))))))).)).))))))|.|||,{((((({{{(((((.((((.((((...((((.,,.....,}}.))))..)))).)))|(((((((((.{...((((....))))...).)))))))))|(((.....((((......))))....}}},))}}},..,,,,,...(((((((((,({..(((((.(((..,,((((......)))))..))).)))))..((((.(((((({,((((((((({.....)))))))))}(((..(((((({.(((((((((((((((((({,(...((((.....(((({,((({,...,|||||.}}}|,.,{{..{{|||||,,,}})))).,)))...))))...)))))))).{{,,.((({{,....|,|,.......,}}...},},}}|......,....,(({,((({(..(((,({(...,}).,)))))}}}}))},.))),,......|||.{{..(((.((((((....))))))..})},,.,,.....(((........)))..))))))))},))).}))))))..)))(((.(((.{((((((...{{{{|,,.....(((....((((((.....))))))...))),,|}||||,.....))))))}.))}}))..}))))))))))...,{{,{{({,{(((((({,{{{{{{(,({(,..,,}}}.})))}),.,}}}}}}}..,)}},,......{||||,|,,...,||{|,,},}}||{,{,...,}},..}}}.}||||||,.....,..}))))}|||{.....}}}}.,,,.....,.))))))))))){|||||...((((((.((((((({......}))).)))).)))))),{{|}}}},.{|||....,}}.,......,)))))))}..}}}},,....},.,,}.,|||{{{{{,{{.{||||,)},))),..,))),.}))))}}.{(((((((.,.,,{{{{{,,,|{((....))((((.(((((...(((((((((.........((.(((((((.,.(((.(((((.(((.........))).)))))))).,.))..))))).))((((((((..(((....))).))))))))...(((.({((((((((..{{{.((((((((((....,(((((................(((.((((((((((((((((..(((......)))..)))),.}).)))).)))))))))))))).,.,.))))))....,)))).)),..)))))))).}).)))....))).)))))).............))))).))))....{{{......))).})))}..)))))))}....{{|...)))...))))))))
Back