Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NF1_0018800
Sequence Length
991 nt
GC Content
0.4410
UCCGCAUUGGAUUGGUGGCCUAAGAUUGAUGCUGUGUAUUGUCACUCGGUUGAACUUCGAAAUAUGUUUGGUGAAACACUUCAUAAAGCAGUGCAAGGUUGUGGAGCACACCCAGCAAUACGAAUGGCACCGAGUCUUACAUUUAAAGAAAAAGUAACAAGCCUUAAAUUUAAAGAAAAACCUACAGACCUGGAGACAAGAAGCUAUAAGUAUCUUCUCUUGUCCAUGGUGAAACUAAUUCAUGCAGAUCCAAAGCUCUUGCUUUGUAAUCCAAGAAAACAGGGGCCCGAAACCCAAGGCAGUACAGCAGAAUUAAUUACAGGGCUCGUCCAACUGGUCCCUCAGUCACACAUGCCAGAGAUUGCUCAGGAAGCAAUGGAGGCUCUGCUGGUUCUUCAUCAGUUAGAUAGCAUUGAUUUGUGGAAUCCUGAUGCUCCUGUAGAAACAUUUUGGGAGAUUAGCUCACAAAUGCUUUUUUACAUCUGCAAGAAAUUAACUAGUCAUCAAAUGCUUAGUAGCACAGAAAUUCUCAAGUGGUUGCGGGAAAUAUUGAUCUGCAGGAAUAAAUUUCUUCUUAAAAAUAAGCAGGCAGAUAGAAGUUCCUGUCACUUUCUCCUUUUUUACGGGGUAGGAUGUGAUAUUCCUUCUAGUGGAAAUACCAGUCAAAUGUCCAUGGAUCAUGAAGAAUUACUACGUACUCCUGGAGCCUCUCUCCGGAAGGGAAAAGGGAACUCCUCUAUGGAUAGUGCAGCAGGAUGCAGCGGAACCCCCCCGAUUUGCCGACAAGCCCAGACCAAACUAGAAGUGGCCCUGUACAUGUUUCUGUGGAACCCUGACACUGAAGCUGUUCUGGUUGCCAUGUCCUGUUUCCGCCACCUCUGUGAGGAAGCAGAUAUCCGGUGUGGGGUGGAUGAAGUGUCAGUGCAUAACCUCUUGCCCAACUAUAACACAUUCAUGGAGUUUGCCUCUGUCAGCAAUAUGAUGUCAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-261.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -282.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((((((....(((((((.(((((((((((((((((((.(...((((.....(((((.(((((....))))).))))).(((..(((.(((...))))))..)))...))))...))))))))......((((((....(((........)))...)))))).............(((((((.(..(((((.((....)).)))))..).)))).)))........(((.((..(((.((((((....))))))..))))).)))....(((........)))..))))))))).))).)))))))...(((((.(((..(((((....))))).......(((....((((((.....))))))...)))(((((.((.....((((((...(((..(((......)))..)))))))))..)).)))))..((..((((((((..(((........)))..)))...(((((......................((((....)))).((.((((((...((((((...(((....((((.((((((((((..(((((((((((....)))).))).))))....)))))))((((.((((((((......)))).)))).))))..((((.......))))....)))))))...)))...))))))..)))))).))..(((.(((((..((..((.((((...((((.........))))...)))).)).))..)))))))).))))).....)))))..))..))).))))).....((((..((.(((((((...(((.(((((.(((.........))).))))))))...))..))))).))..))))..))))))(((((......))))).)))))))))))).((.(((((((((.((((((........)))...)))...)))).)))))((((.....))))((((......)))).....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({,{{|||((({(((({,..(((((({.(((((((((((((((((({,(...((((.....(((({,((({,...,|||||.}}}|,.,{{..{{|||||,,,}})))).,)))...))))...)))))))).{{,,.((({{,....|,|,.......,}}...},},}}|......,....,(({,((({(..(((,({(...,}).,)))))}},}))},.))),,......|||.{{..(({.((((((....))))))..})),,.,,.....(((........)))..))))))))},))).}))))))..||((({.{({..{((({,...|}}}}.......}||.|{|((((((.....))))))((,(({(((((((((((((({,,,(,,{{{.{{{{,{,{{((((((,.,.((({(,(((((({(({,,..,|,|||||||}}||,}}}}}}}}))}.}}},,,..,}}.},}},....|||||,,......||{|.,,,}))}.,{,,,,|||.,,{{({{||{{(((,...{{,(((((({((((....,|||||{{{,....}}}}.,,)})))},,,,|)))))|||||,{{{{{{{|......}))).)))).}}}}|,{{{|,,,,..,||},...,}},}},..,.)))}}}))}}}}}})))))}.},..,},.{{{{|||||||||.(((,...||||..,{,|,,||||},,,|}}},||{}}.,|||||||}}}|||}.,,,},}}}..,|||.|||.|,|||,.|||,.....({.(((((((.{.(((.(((((.(((.........))).)))))))).,.))..))))).})((((((((..(((....))).))))))))..,,,})))})))).|{.{((({((((.((((((........)))...)))...}))).)))))||||....,))))((((......))))},,,.))}
Back