Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NF1_0041500

Sequence Length

2705 nt

GC Content

0.4266

GGCACGCCGCUCACCUUCAUGCACCAGGAGUGUGAAGCCAUUGUCCAGUCUAUCAUUCAUAUCCGGACCCGCUGGGAACUGUCACAGCCCGACUCUAUCCCCCAACACACCAAGAUUCGGCCAAAAGAUGUCCCUGGGACACUGCUCAAUAUCGCAUUACUUAAUUUAGGCAGUUCUGACCCGAGUUUACGGUCAGCUGCCUAUAAUCUUCUGUGUGCCUUAACUUGUACCUUUAAUUUAAAAAUCGAGGGCCAGUUACUAGAGACAUCAGGUUUAUGUAUCCCUGCCAACAACACCCUCUUUAUUGUCUCUAUUAGUAAGACACUGGCAGCCAAUGAGCCACACCUCACGUUAGAAUUUUUGGAAGAGUGUAUUUCUGGAUUUAGCAAAUCUAGUAUUGAAUUGAAACACCUUUGUUUGGAAUACAUGACUCCAUGGCUGUCAAAUCUAGUUCGUUUUUGCAAGCAUAAUGAUGAUGCCAAACGACAAAGAGUUACUGCUAUUCUUGACAAGCUGAUAACAAUGACCAUCAAUGAAAAACAGAUGUACCCAUCUAUUCAAGCAAAAAUAUGGGGAAGCCUUGGGCAGAUUACAGAUCUGCUUGAUGUUGUACUAGACAGUUUCAUCAAAACCAGUGCAACAGGUGGCUUGGGAUCAAUAAAAGCUGAGGUGAUGGCAGAUACUGCUGUAGCUUUGGCUUCUGGAAAUGUGAAAUUGGUUUCAAGCAAGGUUAUUGGAAGGAUGUGCAAAAUAAUUGACAAGACAUGCUUAUCUCCAACUCCUACUUUAGAACAACAUCUUAUGUGGGAUGAUAUUGCUAUUUUAGCACGCUACAUGCUGAUGCUGUCCUUCAACAAUUCCCUUGAUGUGGCAGCUCAUCUUCCCUACCUCUUCCACGUUGUUACUUUCUUAGUAGCCACAGGUCCGCUCUCCCUUAGAGCUUCCACACAUGGACUGGUCAUUAAUAUCAUUCACUCUCUGUGUACUUGUUCACAGCUUCAUUUUAGUGAAGAGACCAAGCAAGUUUUGAGACUCAGUCUGACAGAGUUCUCAUUACCCAAAUUUUACUUGCUGUUUGGCAUUAGCAAAGUCAAGUCAGCUGCUGUCAUUGCCUUCCGUUCCAGUUACCGGGACAGGUCAUUCUCUCCUGGCUCCUAUGAGAGAGAGACUUUUGCUUUGACAUCCUUGGAAACAGUCACAGAAGCUUUGUUGGAGAUCAUGGAGGCAUGCAUGAGAGAUAUUCCAACGUGCAAGUGGCUGGACCAGUGGACAGAACUAGCUCAAAGAUUUGCAUUCCAAUAUAAUCCAUCCCUGCAACCAAGAGCUCUUGUUGUCUUUGGGUGUAUUAGCAAACGAGUGUCUCAUGGGCAGAUAAAGCAGAUAAUCCGUAUUCUUAGCAAGGCACUUGAGAGUUGCUUAAAAGGACCUGACACUUACAACAGUCAAGUUCUGAUAGAAGCUACAGUAAUAGCACUAACCAAAUUACAGCCACUUCUUAAUAAGGACUCGCCUCUGCACAAAGCCCUCUUUUGGGUAGCUGUGGCUGUGCUGCAGCUUGAUGAGGUCAACUUGUAUUCAGCAGGUACCGCACUUCUUGAACAAAACCUGCAUACUUUAGAUAGUCUCCGUAUAUUCAAUGACAAGAGUCCAGAGGAAGUAUUUAUGGCAAUCCGGAAUCCUCUGGAGUGGCACUGCAAGCAAAUGGAUCAUUUUGUUGGACUCAAUUUCAACUCUAACUUUAACUUUGCAUUGGUUGGACACCUUUUAAAAGGGUACAGGCAUCCUUCACCUGCUAUUGUUGCAAGAACAGUCAGAAUUUUACAUACACUACUAACUCUGGUUAACAAACACAGAAAUUGUGACAAAUUUGAAGUGAAUACACAGAGCGUGGCCUACUUAGCAGCUUUACUUACAGUGUCUGAAGAAGUUCGAAGUCGCUGCAGCCUAAAACAUAGAAAGUCACUUCUUCUUACUGAUAUUUCAAUGGAAAAUGUUCCUAUGGAUACAUAUCCCAUUCAUCAUGGUGACCCUUCCUAUAGGACACUAAAGGAGACUCAGCCAUGGUCCUCUCCCAAAGGUUCUGAAGGAUACCUUGCAGCCACCUAUCCAACUGUCGGCCAGACCAGUCCCCGAGCCAGGAAAUCCAUGAGCCUGGACAUGGGGCAACCUUCUCAGGCCAACACUAAGAAGUUGCUUGGAACAAGGAAAAGUUUUGAUCACUUGAUAUCAGACACAAAGGCUCCUAAAAGGCAAGAAAUGGAAUCAGGGAUCACAACACCCCCCAAAAUGAGGAGAGUAGCAGAAACUGAUUAUGAAAUGGAAACUCAGAGGAUUUCCUCAUCACAACAGCACCCACAUUUACGUAAAGUUUCAGUGUCUGAAUCAAAUGUUCUCUUGGAUGAAGAAGUACUUACUGAUCCGAAGAUCCAGGCGCUGCUUCUUACUGUUCUAGCUACACUGGUAAAAUAUACCACAGAUGAGUUUGAUCAACGAAUUCUUUAUGAAUACUUAGCAGAGGCCAGUGUUGUGUUUCCCAAAGUCUUUCCUGUUGUGCAUAAUUUGUUGGACUCUAAGAUCAACACCCUGUUAUCAUUGUGCCAAGAUCCAAAUUUGUUAAAUCCAAUCCAUGGAAUUGUGCAGAGUGUGGUGUACCAUGAAGAAUCCCCACCACAAUACCAAACAUCUUACCUGCAAAGUAAAUAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-717.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -767.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 840.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((((((((((((........)))).))))(((....((((..................))))..)))(((((..(((((.(.((((.(((................))).)))).)....((((((.((((...(((((((.....(((((.........(((((((..((((((.........))))))))))))).........)))))..((((.(((......))).)))).......))).))))..)))).)))))).((..(((((((((.....((((....((.....((((....(((((((((((...(((((((((.((((......))))............((((...((((((((((((((((...)))))))...........(((((....))))))))))))))...)))))))))))))..........(((((((((((((...((((((((((((((....((((((.......)))))).......(((((..((((((((....((((....(((((....))))).))))...........(((((((..(((((((((((...)))))))))))(((((((((.(...((((.....))))))))))))))....(((((((((((((..((((((((((.(((((((...))))))).)))))))))).............))))))))))))).......(((((..((((.(((.................))).))))))))).((((((...(((......)))...))))))......(((((...))))).((.....))(((.(((((((.((((........)))).).))))))))).)))))))((((.......((.((((((.....)))))).))))))..(((((.....))))).((((....)))).))))))))..)))))........(((((........)))))((((((....))))))......(((((((..((((((((.((...)).))).))))).............))))))))))))))))))(((((((.((((.(((((((....((((((...(((((.......))))).((((.(((((((.(((...))).))))))).))))((((((...((((((((((...(((((((....((..(((((((..(((((.(....).))))).......))))))).))..)))))))..)))).((((((....(((((......(((((...................)))))....)))))....))))))..))))))...)))))).(((...)))..))))))....)))))...((((((...(((.(((.(.(((((.((((..((((...(((((.((((..........)))).))))).....))))....(((((............))))).((((((((((.....(((((((((((........((((......))))(((((((((...)))))))))....)))))......((((...((((((...................))))))))))........(((..............)))..))))))..)))))))......)))...........)))).))))).)..))))))...))))))......((((((......)))))).)).))))..)))))))..((.(((.((.((((....)))))).))).))....)))..)))).....))))))))).((((.((((.................(((((((....))).)))))))).))))......(((((((.............(((.....((((.(((((((((.(((...)))...))))..))))).))))..)))..............))))))).)))))))))))...))))))....)))).....)))))))))..))..........)))))..)))))((((((.(((...((((((.((((..(((.(((((.....((((.(((((((...)))).)))..))))...........(((((((.....(((((.((((((...........))))).).)))))......)))..))))((((.((((((((((((((((.(..(((..(((...((.((.(((((.((((((((.....(((((....((.......((..(((...)))..)).......))......))))).......((((((..((((((((((........((((....))))................))))).))))))))))).))))))))))))).)).))((((.....)))).......)))..)))...).))))))))..)))))))).))))...((((...(((((.....)))))((...(((((((.....)))))))....))......))))))))))))..)))).))))))...)))...))))))(.((((((((((..((((......((((..(((..((....))..)))....))))..................))))..)))))))))).)..))))))).))((................................................))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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