Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFIX_0002800
Sequence Length
695 nt
GC Content
0.6014
AAUCCGGACAAUCAGAUAGUUCAAACCAGCAAGGAGAUGCGGACAUCAAACCACUGCCCAACGGGCACUUAAGUUUCCAGGACUGUUUUGUGACUUCCGGGGUCUGGAAUGUGACGGAGCUGGUGAGAGUAUCACAGACUCCUGUUGCAACAGCAUCAGGGCCCAACUUCUCCCUGGCGGACCUGGAGAGUCCCAGCUACUACAACAUCAACCAGGUGACCCUGGGGCGGCGGUCCAUCACCUCCCCUCCUUCCACCAGCACCACCAAGCGCCCCAAGUCCAUCGAUGACAGUGAGAUGGAGAGCCCUGUUGAUGACGUGUUCUAUCCCGGGACAGGCCGUUCCCCAGCAGCUGGCAGCAGCCAGUCCAGCGGGUGGCCCAACGAUGUGGAUGCAGGCCCGGCUUCUCUAAAGAAGUCAGGAAAGCUGGACUUCUGCAGUGCCCUCUCCUCUCAGGGCAGCUCCCCGCGCAUGGCUUUCACCCACCACCCGCUGCCUGUGCUUGCUGGAGUCAGACCAGGGAGCCCCCGGGCCACAGCAUCAGCCCUGCACUUCCCCUCCACGUCCAUCAUCCAGCAGUCGAGCCCGUAUUUCACGCACCCGACCAUCCGCUACCACCACCACCACGGGCAGGACUCACUGAAGGAGUUUGUGCAGUUUGUGUGCUCGGAUGGCUCGGGCCAGGCCACCGGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -254.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.......((....))......((...(((((((((.(.((.......(((((...))))).............(((((((..((((....((.((...((((.(((.(((.(((((((.((((.......))))(((.(((....))).)))(((((.....(((((((((.(((((((......))))....(((..(((((((.(((......((((((((.(((.....))).)).............((........))))))))..((((((...........))))))....))))))))))..))).........(((((.....)))))((((((((.(((((((((((.....(((((.((((((......))).((((((.(((((((.(((..........))))))))))...)))))).((((((........))))))))).)))))...)))))..............))))))...)).)))))).))).).)))))))).....)))))....))))))).))))))))))...)).))....))))..)))))))))).)))))))))..)).((((((((((((..........(((.((((((.(.((..(((.....)))..)).).)))))))))..))))))).)))))........)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.......{{....}}......((...(((((((((.,.{{.,,,...(((((...))))).....},,,....(((((((..((((....(({((...((((.(((.(((.(((((((.((((.......))))(((.(((....))).)))(((((.....(((((((((.(((((((...,{{||}|..,..((..(((((({,(((,{....((((((((.(((.....}}}.}}.............((........)))))))}.,((((((...........)))))),.,})}})))))))..,))|..,.....))))),,,}}),,}}((((((((,(((((((((((|..,,(((((,(({(({......})).((((((.(((((((.(((.......,.,)),}))))))...)))))).((((((........))))))})}.}}})),,.}))))........,,,,,,))))}).,.)),}))))).))).}.)))))))).....)))))....))))))).)})))))))).,,)).})....))))..)))))))}}}.)))))))))..)).((((((((((((....(({,{{,,..{{{.((({(((((.,.....))))))})}).}}.,)))))..))))))).)))))........)))))...
Back