Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PIP5K1A_0002100
Sequence Length
401 nt
GC Content
0.4813
CAGCAUCUGGAAUCAAGAGACCCAUGGCAUCUGAGGUCUUGGAAGCUAGACAGGAUUCUUACAUCUCAUUGGUGCCUUAUGCCUCUGGCAUGCCCAUCAAGAAAAUAGGCCAUAGAAGUGUUGAUUCCUCAGGAGAGACAACAUAUAAAAAGACAACCUCAUCAGCCUUGAAAGGUGCCAUCCAGUUAGGCAUUACCCACACUGUGGGGAGCCUGAGUACCAAACCAGAGCGUGAUGUCCUCAUGCAAGAUUUCUACGUGGUUGAGAGUAUCUUCUUUCCCAGUGAAGGGAGCAACCUGACCCCUGCUCAUCACUACAAUGACUUUCGUUUCAAGACCUAUGCACCUGUUGCCUUCCGCUACUUCCGGGAGCUAUUUGGUAUCCGGCCCGAUGAUUACUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-102.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -109.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 112.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((..((..((((((((.......)).)))))).))..)))))((((...........(((((((.(((..(((((..((((...(((...(((..((((((.(((((..((.((((.......(((((((............(((....(((.((((((..(((((((((.......((((((....(((((...)))))..)))))))))))........((((((.....))))))....)))).....)))))))))..)))))))))).(((((...(((((..........))))).)))))..(((((...))))))))).)))))))..))))))..)))...........))).))))...)))))..))))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,(,(({((..,{..(({(((,(,(,,.,|||,|||}}|(((({,,.{{((((.........,,({.{(((,({,.,(((((...)))))},,}},,,}}}..,{{|(.(((((..((,((({,,{,...||||{{{,,,,,,.....,(((....(((.((((((.,(,,,(((((.......((((((.,..(((((...))))).,)))))))))))........((((((.....))))))....,,}}.....)))))))))..}}})))))}}.(((((.,,(((((..........))))).)))))..,{{({...,}))}})}}.}))))))..)))))),.)))}}}..,,})}}))).)))},..))}|},,|}}),))))..,.,,..
Back