Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PIP5K1A_0003900

Sequence Length

483 nt

GC Content

0.4783

GUGCCUUAUGCCUCUGGCAUGCCCAUCAAGAAAAUAGGCCAUAGAAGUGUUGAUUCCUCAGGAGAGACAACAUAUAAAAAGACAACCUCAUCAGCCUUGAAAGGUGCCAUCCAGUUAGGCAUUACCCACACUGUGGGGAGCCUGAGUACCAAACCAGAGCGUGAUGUCCUCAUGCAAGAUUUCUACGUGGUUGAGAGUAUCUUCUUUCCCAGUGAAGGGAGCAACCUGACCCCUGCUCAUCACUACAAUGACUUUCGUUUCAAGACCUAUGCACCUGUUGCCUUCCGCUACUUCCGGGAGCUAUUUGGUAUCCGGCCCGAUGAUUACUUGUAUUCCCUCUGCAGUGAGCCGCUGAUUGAACUCUGUAGCUCUGGAGCUAGUGGUUCCCUAUUCUAUGUGUCCAGCGACGAUGAGUUCAUUAUUAAGACAGUCCAACAUAAAGAGGCGGAAUUUCUGCAGAAGCUGCUUCCAGGAUACUACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-124.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -132.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 90.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((...(((((...))))))))(((......((((((.(((((..((.((((.......(((((((............(((....(((.((((((..(((((((((.......((((((....(((((...)))))..)))))))))))........((((((.....))))))....)))).....)))))))))..)))))))))).(((((...(((((..........))))).)))))..(((((...))))))))).)))))))..))))))((.(((((.......)))))))....((((((((((..............(((...(.(((((((.((.(((((...(((((((.....(.(((((.(..((((.........))))..)))))).).....))))))).........................)))))..)).))))))).).)))..)).)))))))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,((...(((((...))))))}}{{|.,.,..((((((.(((((..((.((({..,,...{((((({...........,(((....(((.((((((.,(,,,(((((.......((((((.,..(((((...))))).,)))))))))))........((((((.....))))))....,,}}.....)))))))))..)})))))))}.(((((.,,(((((..........))))).)))))..,{{({...}})}})))).)))))))..)))))){.|(((((.......))))))}....{(((((((((,..{{.,,,.....||,.,,..(((((((.{{.(((((..{(((((((..,.,(.(((((.(..((((.........))))..}))))).).,...))))))).........................)))))..}}.))))))).,..}},.}}.)))))))}.}))