Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PTK2_0001000

Sequence Length

843 nt

GC Content

0.5302

CCCAGCAGACCGGGUUAUCCCAGUCCGAGGUCCAGCGAAGGAUUUUAUCCCAGCCCACAGCACAUGGUACAAACCAAUCAUUACCAGGUUUCUGGCUACCCUGGUUCACAUGGAAUCACAGCCAUGGCUGGCAGCAUCUAUCCAGGUCAGGCAUCUCUUUUGGACCAAACAGAUUCAUGGAAUCAUAGACCUCAGGAGAUAGCAAUGUGGCAGCCCAAUGUGGAGGACUCUACAGUAUUGGACCUGCGAGGGAUUGGGCAAGUGUUGCCAACCCAUCUGAUGGAAGAGCGUCUAAUCCGACAGCAACAGGAAAUGGAAGAAGAUCAGCGCUGGCUGGAAAAAGAGGAAAGAUUUCUGAAACCUGAUGUGAGACUCUCUCGAGGCAGUAUUGACAGGGAGGAUGGAAGUCUUCAGGGUCCGAUUGGAAACCAACAUAUAUAUCAGCCUGUGGGUAAACCAGGUAAAGAAGAAAAGAAUUGGGCGGAAAGAAAUCCUGCAGCUCCACCAAAGAAACCGCCUCGCCCUGGAGCUCCCGGUCAUCUGGGAAGCCUUGCCAGCCUCAGCAGCCCUGCUGACAGCUACAACGAGGGUGUCAAGCCAUGGAGGCUUCAGCCCCAGGAAAUCAGCCCCCCUCCUACUGCCAACCUGGACCGGUCGAAUGAUAAGGUGUACGAGAAUGUGACGGGCCUGGUGAAAGCUGUCAUCGAGAUGUCCAGUAAAAUCCAGCCAGCCCCACCAGAGGAGUAUGUCCCUAUGGUGAAGGAAGUCGGCUUGGCCCUGAGGACAUUAUUGGCCACUGUGGAUGAGACCAUUCCCCUCCUACCAGCCAGCACCCACCGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-255.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -272.2

Frequency: 0.0000

Diversity: 279.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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