Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0017800
Sequence Length
318 nt
GC Content
0.4057
UAACAAUGCGUCAGUUUGACCAUCCUCAUAUUGUGAAGCUGAUUGGAGUCAUCACAGAGAAUCCUGUCUGGAUAAUCAUGGAGCUGUGCACACUUGGAGAGCUGAGGUCAUUUUUGCAAGUAAGGAAAUACAGUUUGGAUCUAGCAUCUUUGAUCCUGUAUGCCUAUCAGCUUAGUACAGCUCUUGCAUAUCUAGAGAGCAAAAGAUUUGUACACAGGGACAUUGCUGCUCGGAAUGUUCUGGUGUCCUCAAAUGAUUGUGUAAAAUUAGGAGACUUUGGAUUAUCCCGAUAUAUGGAAGAUAGUACUUACUACAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-81.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.58
Frequency: 0.0002
Diversity: 44.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((..((((((.((.((......)).)).))))))(((((.((.(((.(((((..(((((((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((....(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))).....))).....)))))..)))))))).)).)))))............))).)))((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({...,,,((((((((.((.({......}}.)).)))))))|{((,{{.(((.(((((..(((({((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((,...(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..}},)}}.....)))))..)))))))).}},)}}...........,,,})},||}{{....))
Back