Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0021500
Sequence Length
1449 nt
GC Content
0.4320
AAUAUGACAGAUACCUAGCAUCUAGCAAAAUAAUGGCAGCUGCUUACCUUGACCCCAACUUGAAUCACACACCAAAUUCGAGUACUAAGACUCACCUGGGUACUGGUAUGGAACGUUCUCCUGGUGCAAUGGAGCGAGUAUUAAAGGUCUUUCAUUAUUUUGAAAGCAAUAGUGAGCCAACCACCUGGGCCAGUAUUAUCAGGCAUGGAGAUGCUACUGAUGUCAGGGGCAUCAUUCAGAAGAUAGUGGACAGUCACAAAGUAAAGCAUGUGGCCUGCUAUGGAUUCCGCCUCAGUCACCUGCGGUCAGAGGAGGUUCACUGGCUUCACGUGGAUAUGGGCGUCUCCAGUGUGAGGGAGAAGUAUGAGCUUGCUCACCCACCAGAGGAGUGGAAAUAUGAAUUGAGAAUUCGUUAUUUGCCAAAAGGAUUUCUAAACCAGUUUACUGAAGAUAAGCCAACUUUGAAUUUCUUCUAUCAACAGGUGAAGAGCGAUUAUAUGUUAGAGAUAGCUGAUCAAGUGGACCAGGAAAUUGCUUUGAAGUUGGGUUGUCUAGAAAUACGGCGAUCAUACUGGGAGAUGCGGGGCAAUGCACUAGAAAAGAAGUCUAACUAUGAAGUAUUAGAAAAAGAUGUUGGUUUAAAGCGAUUUUUUCCUAAGAGUUUACUGGAUUCUGUCAAGGCCAAAACACUAAGAAAACUGAUCCAACAAACAUUUAGACAAUUUGCCAACCUUAAUAGAGAAGAAAGUAUUCUGAAAUUCUUUGAGAUCCUGUCUCCAGUCUACAGAUUUGAUAAGGAAUGCUUCAAGUGUGCUCUUGGUUCAAGCUGGAUUAUUUCAGUGGAACUGGCAAUCGGCCCAGAAGAAGGAAUCAGUUACCUAACGGACAAGGGCUGCAAUCCCACACAUCUUGCUGACUUCACUCAAGUGCAAACCAUUCAGUAUUCAAACAGUGAAGACAAGGACAGAAAAGGAAUGCUACAACUAAAAAUAGCAGGUGCACCCGAGCCUCUGACAGUGACGGCACCAUCCCUAACCAUUGCGGAGAAUAUGGCUGACCUAAUAGAUGGGUACUGCCGGCUGGUGAAUGGAACCUCGCAGUCAUUUAUCAUCAGACCUCAGAAAGAAGGUGAACGGGCUUUGCCAUCAAUACCAAAGUUGGCCAACAGCGAAAAGCAAGGCAUGCGGACACACGCCGUCUCUGUGUCAGAAACAGAUGAUUAUGCUGAGAUUAUAGAUGAAGAAGAUACUUACACCAUGCCCUCAACCAGGGAUUAUGAGAUUCAAAGAGAAAGAAUAGAACUUGGACGAUGUAUUGGAGAAGGCCAAUUUGGAGAUGUACAUCAAGGCAUUUAUAUGAGUCCAGAGAAUCCAGCUUUGGCGGUUGCAAUUAAAACAUGUAAAAACUGUACUUCGGACAGCGUGAGAGAGAAAUUUCUUCAAGAAGCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-362.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 456.0
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.....)))....((.(((.......((((.((((((((..............((((((((..........)))))))).....((((((.((((((.((((((((((..(((((((....(((((((..............(.((((((......)))))))((((.((.(((.........))))).))))...(((.((((...((((.....((((((((((.((............((((....))))............((((((((((((((......))....(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..)))))))..(((.......((((((.(.((((((((....((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((....)).)))))))..)))........)))))))))((((((((.......))))(((.(((((((((.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).............((((...(((((...((....))....)))))))))..(((...((.((((....)))).))..))))))))))))))))))))))))))))).((((((....))))))....(((((.....).))))........))))))))))))))).......)))(((.(((......((((..((.(((((((..(((((..........))))).....))))))).)))))).......))).)))...........))))))))).)))..)))))))))))).....)))))))).)))..))))))))))))))..(((.((((((.....))))).).)))(((((.(((........)))))))).))))).)))))))).)))...((.((((((.....)))))).))....(((((.((((((....((.....))..(((.((......)).)))(((((.((((((........))))...)).)))))......(((((......))).))((((((..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).))).)))....)))))))))))((((((........))))))...))))))(((((.......))))))))))))).))))...(((((.....(((.....)))...)))))(((((....)))))...))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,({,,{,,,..,,.({,|||.},....,.(({(((((((,({{((((.......((((((((..........)))))))),,,..,{{{{..{{||||.{||||{,{{,..(((((((....(((((((..............{.((((((......))))))}{(((.((.{((,......,})}})).)))}..,(((.((((..,((((.,,,.{(((((((((,{{..,,....,},.((({....||||.........,.,{||{(((((((((,((((({{{((.{((((((,,,|,.,,.},}}}},|,|{||{(((({|{(((({{,{(((((((((((((((((({(((((....}}}).))).)}|,(({.....,))),,{{(((((((...})))))}.}}||(((....{.{(((((,...(((....))).{(((((.((((((((((({{(((({.,((..,.}}|||,}|((,{((....,,,...,,}.})),.)},.,},},..}}}}))}},,})))))))))).)))))))))))}.})))},)))))))}}})))))),{{,...((((((.((...((((((..,((,...,,,..},|...((((((((((..,..((({,{({{{((({{((.(({{,,(((((({{.((..((,,......||..},....,|}}}},..},}}.})))).....{{(((,..(({...,}||,{,.,((((({((...,{{|{{{({((,.((({...,||||,.}))},},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..,,.}}})))}))}}}..|||...,,,..))))))..,,..))}.)))))))...))))))..)).))))))..}}...}.}})))},..,.)))))).}..,}}}.,,...))))).),..........})))))))).)))..},)))))))))),,,..)))))))).))}..))))))))))))))..(((.((((((.....))))).).)))(((((((((,{{,....},,,,})).))}})}))))),)),},,....})))))).}}}})}.)))))}.....((((((((((((....((.....))..(((.{({(......}))|{(((({((,{{{...,}},,,}}}..,})}}},}}...,,,||{{{......))}.,.((({{{..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).)}},}))....)))))))))))|{{|||.,.,..,|||,|||...,,.|||(,(((....{{{,|||,||||||,,......}}}.}}}.,,,.}}),.}}}.}))).,,.{((((((....))))))},.},.)))}
Back