Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0029700
Sequence Length
1209 nt
GC Content
0.4409
AAUAUGACAGAUACCUAGCAUCUAGCAAAAUAAUGGCAGCUGCUUACCUUGACCCCAACUUGAAUCACACACCAAAUUCGAGUACUAAGACUCACCUGGGUACUGGUAUGGAACGUUCUCCUGGUGCAAUGGAGCGAGUAUUAAAGGUCUUUCAUUAUUUUGAAAGCAAUAGUGAGCCAACCACCUGGGCCAGUAUUAUCAGGCAUGGAGAUGCUACUGAUGUCAGGGGCAUCAUUCAGAAGAUAGUGGACAGUCACAAAGUAAAGCAUGUGGCCUGCUAUGGAUUCCGCCUCAGUCACCUGCGGUCAGAGGAGGUUCACUGGCUUCACGUGGAUAUGGGCGUCUCCAGUGUGAGGGAGAAGUAUGAGCUUGCUCACCCACCAGAGGAGUGGAAAUAUGAAUUGAGAAUUCGUUAUUUGCCAAAAGGAUUUCUAAACCAGUUUACUGAAGAUAAGCCAACUUUGAAUUUCUUCUAUCAACAGGUGAAGAGCGAUUAUAUGUUAGAGAUAGCUGAUCAAGUGGACCAGGAAAUUGCUUUGAAGUUGGGUUGUCUAGAAAUACGGCGAUCAUACUGGGAGAUGCGGGGCAAUGCACUAGAAAAGAAGUCUAACUAUGAAGUAUUAGAAAAAGAUGUUGGUUUAAAGCGAUUUUUUCCUAAGAGUUUACUGGAUUCUGUCAAGGCCAAAACACUAAGAAAACUGAUCCAACAAACAUUUAGACAAUUUGCCAACCUUAAUAGAGAAGAAAGUAUUCUGAAAUUCUUUGAGAUCCUGUCUCCAGUCUACAGAUUUGAUAAGGAAUGCUUCAAGUGUGCUCUUGGUUCAAGCUGGAUUAUUUCAGUGGAACUGGCAAUCGGCCCAGAAGAAGGAAUCAGUUACCUAACGGACAAGGGCUGCAAUCCCACACAUCUUGCUGACUUCACUCAAGUGCAAACCAUUCAGUAUUCAAACAGUGAAGACAAGGACAGAAAAGGAAUGCUACAACUAAAAAUAGCAGGUGCACCCGAGCCUCUGACAGUGACGGCACCAUCCCUAACCAUUGCGGAGAAUAUGGCUGACCUAAUAGAUGGGUACUGCCGGCUGGUGAAUGGAACCUCGCAGUCAUUUAUCAUCAGACCUCAGAAAGAAGGUGAACGGGCUUUGCCAUCAAUACCAAAGUUGGCCAACAGCGAAAAGCAAGGCAUGCGGACACACGCCGUCUCUGUGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-315 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -340.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.....(((.((((((..((.....((((..((((.....((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).)).....))))..))))..))..)))))).)))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))........(((((((......((..........))......)))))))....(((....)))((((.((......)).))))((((.((((((....((((...((.((((.........(((.((((((.....))))).).)))(((((((((((((..........))))...))))))).))..........((((....(((...))).....))))...((((.....)))).....))))))...).))).....)))))).)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((.{...{{,({..}},)}......((((((((((.(((((((.....,.((((((((..........)))))))|,{{,..,{{{..{{||||.{||||{|||,..(((((((....(((((((..............{.((((((......))))))}{(((.((.{((,......}})}})).)))}...(((.((((..,((((.,,,.{(((((((((,{{..,,....,},.((({...,||||.........,.,|||{(((((((((.((((({{{((.{((((((,,,|,.,,,|,}}}},|,|{||((((({{{(((({(,{(((((((((((((((((({(((((....}))).))).))|,(({...,.,))),{{{(((((((...})))))}.}}||(((....{.{(((((,...(((....))).{(((((.((((((((((({{(((({.,{{..,.}}|||,}|(({{({....,,,...,,}.})),.)},.,},},.,}}}}))}},,})))))))))).)))))))))))}.})))},)))))))}}})))))),{{,...((((((.((...((((((..,((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,{(({{((({{((.(({{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,|}}},,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}}))))))}}}..|||...,,,.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))..}}...},|}}}}},..,.)))))}.}..,}}}.,,...))))).),..........})))))))).)))..,,)))))))))),.,..)))))))).))}..))))))))))))))..(((.((((((.....))))).}.)))(((((((((,{{,....,,,,,))).))}})}))))),)).},,....))))))).},)})..}))))){{{{......}}))|{{....{{.....)).,|||..(((,.....})),))}},),))))).
Back