Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0031800
Sequence Length
476 nt
GC Content
0.4391
GCCAAAACACUAAGAAAACUGAUCCAACAAACAUUUAGACAAUUUGCCAACCUUAAUAGAGAAGAAAGUAUUCUGAAAUUCUUUGAGAUCCUGUCUCCAGUCUACAGAUUUGAUAAGGAAUGCUUCAAGUGUGCUCUUGGUUCAAGCUGGAUUAUUUCAGUGGAACUGGCAAUCGGCCCAGAAGAAGGAAUCAGUUACCUAACGGACAAGGGCUGCAAUCCCACACAUCUUGCUGACUUCACUCAAGUGCAAACCAUUCAGUAUUCAAACAGUGAAGACAAGGACAGAAAAGGAAUGCUACAACUAAAAAUAGCAGGUGCACCCGAGCCUCUGACAGUGACGGCACCAUCCCUAACCAUUGCGGAGAAUAUGGCUGACCUAAUAGAUGGGUACUGCCGGCUGGUGAAUGGAACCUCGCAGUCAUUUAUCAUCAGACCUCAGAAAGAAGGUGAACGGGCUUUGCCAUCAAUACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-102.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 122.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((.......((((...............(((....(((..........((((((...((....))....))))))(((.(((..((.((((((..((.((((((..((.....)))))))).)).....(((((..((((((....)))))).)))))((((....(((((.....(((..(((((((((....))....(((.((((.(((......((((..((.(((((((..(((((..........))))).....))))))).)))))).......))).(((((..........)))))..)))))))....(((((.(((((..((.......))....))))))))))....))))))))))......)))))..)))))))))).))..)))..)))))))))...............))))......))))....)))((((..........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....((((.....(((((((((............{,....(({({,..(({....}}},,,.,{({{{|||,,,,{{{(((({((,.((({...,|||||,}})|.}|,,},,)))}}|,}}|{{|..,,,,)))|((((..((((((....)))))).)))))))}}}||.,....,,.,..))},)))))).{{,...}}....(((.((({.,{(,.....((({.{({.(((((((..{((((..........))))}.....))))))).},,)}}.,},...}}..(((((..........)))))}})))))))..,.(((((.(((((..((......,}}....)))))))))).....(((.((((((.....))))).).)))((((((((({(((,,,......}}},)},,))))))).)),|.....,,.))))....)))((((..........))))
Back