Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0044400
Sequence Length
335 nt
GC Content
0.4418
GGCAUCAUUCAGAAGAUAGUGGACAGUCACAAAGUAAAGCAUGUGGCCUGCUAUGGAUUCCGCCUCAGUCACCUGCGGUCAGAGGAGGUUCACUGGCUUCACGUGGAUAUGGGCGUCUCCAGUGUGAGGGAGAAGUAUGAGCUUGCUCACCCACCAGAGGAGUGGAAAUAUGAAUUGAGAAUUCGUUAUUUGCCAAAAGGAUUUCUAAACCAGUUUACUGAAGAUAAGCCAACUUUGAAUUUCUUCUAUCAACAGGUGAAGAGCGAUUAUAUGUUAGAGAUAGCUGAUCAAGUGGACCAGGAAAUUGCUUUGAAGUUGGGUUGUCUAGAAAUACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-85.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -92.7
Frequency: 0.0000
Diversity: 62.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......)).........(((((((((.(((..(((((((.((..((((((((.((((.(((.((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......((((....)))).))))..))))..))))..)))))))))...))))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,......,,.........(((((((((.((,..(((((((.{(..(((((({{.({{{,((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((({.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))}.,.....((((....)))),))))..)))).,))))..}})))))))...})))))))))))........
Back