Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SETDB1_0004500
Sequence Length
440 nt
GC Content
0.5432
GAUGACAAAAGAUGUGAGUGGAUCUAUCGAGGCUCUACACGGCUGGAGCCCAUGUUCAGCAUGAAAACAUCCUCAGCCUCUGCACUGGAGAAGAAGCAAGGACAGCUCAGGACACGUCCAAAUAUGGGUGCUGUGAGGAGCAAAGGCCCUGUUGUCCAGUACACACAGGAUCUGACCGGUACUGGAACCCAGUUCAAGCCAGUGGAACCCCCACAGCCUACAGCUCCACCUGCCCCACCUUUCCCACCUGCUCCACCUCUAUCCCCCCAAGCAGGUGACAGUGACUUGGAAAGCCAGCUUGCCCAGUCACGGAAGCAGGUAGCCAAAAAGAGCACGUCCUUUCGACCAGGAUCUGUGGGCUCUGGUCAUUCCUCCCCUACAUCUCCUGCACUCAGUGAAAAUGUCUCUGGUGGGAAACCUGGGAUCAACCAGACAUAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-134.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -141.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....))))((.....(((.(((((((((....(.((((((.((((.(((....)))......(((.((.(.(.(((((..((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........((((.....)))).))))...))))).)).)))))((((((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).))))))))))..)))).........))))..)))))).)...(((((..((((((....((.....))...))))))..)))))(((...)))......))))))))))))...((((......))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{.....{((((({,{.(({,|,.....{(((((.{{{{((.,,,|||((((({..||,||......{{((.{((.({({{.{{,,,,.,}..}},,||,,.|||,}}}|,,,}}}|.}}}}))))))})))}.}))))...(({,(((,.,({{{{{{{...{{(,..))}.,.{|}|||||}..,))),....))).{{((,,...|||}(((((((((.(((((((((.,,....,,,,((((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).)))))))),,)))))).((......}.))..(({.....)})..))).))))))))).}))...,}))}}}}})))))))|{||({{.{((.{{.....)).))))))}},...((((......))))......,}
Back