Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SLC8A1_0003300
Sequence Length
576 nt
GC Content
0.4948
GCCAACCUGUCUUCAGGAAGGUUCAUGCUAGAGAACAUCCGAUUCUCUCUACUGUAAUCACCAUUGCAGACGAAUAUGAUGACAAGCAGCCACUGACCAGCAAAGAGGAAGAGGAGAGGCGCAUUGCAGAAAUGGGGCGCCCCAUCCUGGGAGAGCACACCAAGUUGGAAGUGAUCAUUGAAGAAUCCUAUGAAUUCAAGAGUACUGUGGACAAACUCAUUAAGAAGACAAACCUGGCCCUUGUGGUUGGGACUAACAGCUGGAGAGAACAGUUCAUUGAAGCUAUCACUGUCAGUGCUGGGGAAGAUGAUGACGACGAUGAAUGUGGGGAAGAGAAGCUGCCCUCCUGUUUCGAUUACGUGAUGCACUUUCUGACUGUGUUCUGGAAGGUCCUGUUUGCCUUCGUCCCCCCUACUGAAUACUGGAAUGGCUGGGCGUGUUUCAUUGUCUCCAUCCUCAUGAUUGGCCUACUGACAGCUUUCAUUGGAGACCUGGCUUCCCACUUUGGCUGCACCAUUGGCCUGAAAGAUUCUGUGACUGCAGUCGUGUUCGUCGCACUUGGAACAUCAGUGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-156.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -169
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.6
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((....))))..)))(...((.(((((((....).))))))..((((......(((.(((.((((((((((((.....((((.(((...(((((..........(((((.(((((....((....))..))))).).))))((.........))..))))).((((.((.(((((............))))))).))))((((......))))..((((.........((((...(((((..((.((((.((.(((.(((..(((((((.(((((......((((((((....(((..(((.((((.((.........((((((.((((((((((((..((((((((.....(((...))).........((((((..((((((.......))))))............))))))))))))))..))))).))))).)).)))))))).)))).)))..))))))))))).))))).))))...)))..))))))))))))))..))))).)))).......))))))).)))).)))))))))))))))..))).....))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((....))))..))){...,.,((((({,......}}}))),,|,(((({{....|})))}((((((((((((.....((((.(((,,.(({{{.....|}...(((({.(((((..,.((....)).,))))).}.))))((,......,.))..|||}}.((({.((.(((((...,,....,..)))))||,|}}},|.|,,...}||....,{,,.......{,((((...(((((.,{(.((((.((.(((.(((..(((((((.((((({,....,{((((((....(((..(((.((((.({........,((((((.({((((((((((..((((((((.....{,(,.{{{|.........||||||.,((((((.......))))))............}},,,,})))))))..))))).))))).)).)))))))).)))).)))..))))))))))))})))).))))...))).,))))))))))))))..))))).)))).,.....,))}))).)))).))))))))))))|||{,|{|.....))))))..)
Back