Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCA5_0003500
Sequence Length
357 nt
GC Content
0.3585
GCUGCUUUUGUCAGAGACGUUUUAUUACCGGGAGAAUGGGAUGUAUGUGUAACAUCUUAUGAAAUGCUUAUUAAAGAGAAGUCUGUGUUCAAAAAAUUUAAUUGGAGAUACUUAGUAAUAGAUGAAGCUCACAGGAUCAAAAAUGAAAAAUCUAAGUUGUCAGAAAUAGUGAGGGAAUUCAAGACUACAAAUAGACUAUUAUUAACUGGAACACCUCUUCAGAACAACUUGCAUGAGCUGUGGUCACUUCUUAACUUUCUGUUGCCAGAUGUGUUUAAUUCAGCAGAUGACUUUGAUUCCUGGUUUGAUACAAACAACUGCCUUGGGGAUCAAAAACUAGUUGAGAGGCUUCAUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-65.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -73.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((....(((.((((((((............(((((((.......))))))))))))))))))....))))).)))((((.(((((.........))))).)))...........(((((((((((((..(((.............(((((((((.(((.....((((...((((((.(((....))).)).........))))...))))))).).))))))))..))).)))))......((((((((.(((((((...(((.......))))))))))....((((((((((((((((.......)))..)))..))))))))))....))))))))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{(((((.((.((((.((((.({{..((,,..(((((((((.......)))))))))....}.))}..}}).)))}.)))).}}..|}}},.......|||||,,},,,,.,,..,,|{{{{(((((({{{..(({....,},....,.(((((((((.(((.....((((...(((,{(..,,..,,||,..,.,,.....,)}))...))))))).),})))))))..)))}))}))},,.{{((((((((.(((((((...{{{.....,.,,,)))))))....((((((((((((({((.......}}}..)))..))))))))))....))))))))))}}}}},.})
Back