Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0012400
Sequence Length
433 nt
GC Content
0.4711
GUUCCUGCUGCUCAACAGAUGCUAAAUUUUCCUGAGAAAAACAAGGAAAAACCAGUUGAUUUGCAGAACUUUGGUCUCCGUACUGACAUUUACUCCAAGAAAACAUUAGCAAAGAGUAAAGGUGCUAGUGCUGGAAGAGAAUGGACUGAACAGGAGACCCUUCUACUCCUGGAGGCCCUGGAGAUGUACAAGGAUGAUUGGAACAAAGUGUCGGAACAUGUUGGAAGUCGUACUCAGGAUGAAUGCAUCCUCCACUUUUUGAGACUUCCCAUUGAGGACCCAUACCUUGAGAAUUCAGAUGCUUCCCUUGGGCCUUUGGCCUACCAGCCUGUCCCCUUCAGUCAGUCAGGAAAUCCAGUUAUGAGUACUGUUGCUUUUUUGGCAUCUGUGGUGGACCCUCGCGUGGCAUCUGCUGCAGCAAAAGCGGCUUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -129.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((....(((((((((..(((((((..........)))))))..(((((.((((............(((((((((((.(((((((((..................))))))..))).)))))).)).))))))).)))))..((((((.........))))))(((((((.((.((.(((((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))..........))).))))..))))))).(((......))).((((((..(((...(((((((((..((((.......))))....)))))))))..))).)).)))).......)))))))))..))))))..)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((((....(((((((((..(((((((..........)))))))..(((((.((((..,,......,,(({{{{{{({{,{,{{({(((...,..............|||||}.,|||{|}}}||,|||.},}}}}.|||||..((((((.........))))))(((((((.((.((.((({,{({{({.,{,{..{{,.((({,,{..|,|,,,(((((((.,,...((((((....))))))........,}.))))))),}},,.|,.}},)},)}))),...,}}...))).))))..))))))).(((......))).({{{,{,.{{{,,.{{{{{{{{{,||||{.....,,)))}.,},))))))))),,))),)).)))),,.....}))}})))),.))))))..)))........
Back