Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0015800
Sequence Length
454 nt
GC Content
0.4339
UAUUCAUGUGAUUGAACGGCGUGCUCUUCCUGAGUUCUUCAAUGGAAAAAACAAAUCCAAGACUCCAGAAAUAUACUUGGCAUAUCGAAAUUUUAUGAUUGACACGUAUCGUCUAAACCCCCAAGAGUAUUUAACUAGCACUGCUUGUCGGAGGAACUUGACUGGAGAUGUGUGUGCUGUGAUGAGGGUCCAUGCCUUUUUAGAGCAGUGGGGACUCGUUAAUUACCAAGUUGACCCGGAAAGUAGACCCAUGGCAAUGGGACCUCCUCCUACUCCUCAUUUUAAUGUAUUAGCUGAUACCCCCUCUGGGCUUGUGCCUCUGCAUCUUCGAUCACCUCAGGUUCCUGCUGCUCAACAGAUGCUAAAUUUUCCUGAGAAAAACAAGGAAAAACCAGUUGAUUUGCAGAACUUUGGUCUCCGUACUGACAUUUACUCCAAGAAAACAUUAGCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-105.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -113.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((.((.((.((((.(..((((....((.(((((((.(((((((.........)))).........((((((.(((((((((.........))))...(((.......))).......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))..........))).))))))).)).....))))...).)))).)))).))).)(.........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((.((.((.({((.{,,((((....((.(((((((.{{,((((.........}))}.,..,..,.((((((.(((((,,,{.........||||,,.{{{....,..))}.......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((,..,(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|{.((((..((((((({,{{.{{{.(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))).}))...)})))))).))..))))}...((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))....,},.,.}}).))))))}.)).....))}).}.).}})}.)))).))).){......,,.)
Back