Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0017400
Sequence Length
462 nt
GC Content
0.4372
GAAGAUGAAGAUCCUGCCAAAGGUGAUCAGAGUCGAUCAGUUGACCUUGGGGAAGAUAAUGUGACAGAGCAGACCAAUCACAUUAUUAUUCCUAGUUAUGCAUCAUGGUUUGAUUAUAACUGUAUUCAUGUGAUUGAACGGCGUGCUCUUCCUGAGUUCUUCAAUGGAAAAAACAAAUCCAAGACUCCAGAAAUAUACUUGGCAUAUCGAAAUUUUAUGAUUGACACGUAUCGUCUAAACCCCCAAGAGUAUUUAACUAGCACUGCUUGUCGGAGGAACUUGACUGGAGAUGUGUGUGCUGUGAUGAGGGUCCAUGCCUUUUUAGAGCAGUGGGGACUCGUUAAUUACCAAGUUGACCCGGAAAGUAGACCCAUGGCAAUGGGACCUCCUCCUACUCCUCAUUUUAAUGUAUUAGCUGAUACCCCCUCUGGGCUUGUGCCUCUGCAUCUUCGAUCACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-118.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -129.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.........))(((....((((((((((((...(((((((((.(((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....)))))))(((.....)))(((...))).((.((((((((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....)))))...)))))).))................))))))))).....))))((((....))))..........)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.,,,....,)){{{,,..((((((((.{(({{(({{{,{||||(((((((.{(((.(((((..((((((..((((((((((.,.(({...,(((((((.((((.....)))))))))))))).,.)))))))),...})..)))))},,{{(((,,((,...{(((.........)))))))))},}).......,,||,{{{{,,,......,,}),,,}.))))),,.)))}....))))))),||.....}|,{((...})}.||{({{{{,,{||},|,(({(({{({.,{({{.(((,((((,{,,,,||||}.,}),}))}{,|||{..||((((({{||.|{|}|{{,..{{,.|{|{(.(((((....)))))...,,,}})}}}}}}}}}.,,,...}}}))))),)),.}}}})}},|(((....)))).,}))})}}}))))))))}})
Back