Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPARC_0001400

Sequence Length

553 nt

GC Content

0.5750

GUGUGCAGCAAUGACAACAAGACCUUCGACUCUUCCUGCCACUUCUUUGCCACAAAGUGCACCCUGGAGGGCACCAAGAAGGGCCACAAGCUCCACCUGGACUACAUCGGGCCUUGCAAAUACAUCCCCCCUUGCCUGGACUCUGAGCUGACCGAAUUCCCCCUGCGCAUGCGGGACUGGCUCAAGAACGUCCUGGUCACCCUGUAUGAGAGGGAUGAGGACAACAACCUUCUGACUGAGAAGCAGAAGCUGCGGGUGAAGAAGAUCCAUGAGAAUGAGAAGCGCCUGGAGGCAGGAGACCACCCCGUGGAGCUGCUGGCCCGGGACUUCGAGAAGAACUAUAACAUGUACAUCUUCCCUGUACACUGGCAGUUCGGCCAGCUGGACCAGCACCCCAUUGACGGGUACCUCUCCCACACCGAGCUGGCUCCACUGCGUGCUCCCCUCAUCCCCAUGGAGCAUUGCACCACCCGCUUUUUCGAGACCUGUGACCUGGACAAUGACAAGUACAUCGCCCUGGAUGAGUGGGCCGGCUGCUUCGGCAUCAAGCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-175.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -185.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 141.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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