Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPG11_0008900

Sequence Length

1123 nt

GC Content

0.4622

CUUAACACAGCAGCCACAAAGGUCCACCCUGUCAUCCCUGCCAUGUGGCUGGAGGAUCAGGUGUGUUUCCUUUUGAAGCUUAUGCUACAGCAGUGUAAGACCCAGUAUGAGCUGGGGAAGCUUUUACAGCUCUUUGUUGAAAGAGAGCAUCUCUUCUCUGAUGGUCCAGAUGUGAAAAAGCUUUGCAUCCUUUGCCAGAUUUUGAAGGAUACAUCCAUAGCCAUUAAUCAUACAAUUAUUACCAGCUACAGCAUUGAGAAUCUUCAGCAUGAAUGUAGAUCUAUUUUGGAAAGACUGCAGACAGAUGGACAAUUCGCUUUGGCCAGGAGGGUAGCAGAAUUAGCUGAGUUACCUGUGGACAACUUGGUUAUUAAAGAGAUAACACAGGAAAUGCAGACCCUAAAACACAUUGAACAGUGGUCACUAAAACAAGCAAGAAUUGACUUCUGGAAAAAAUGCCAUGAGAAUUUUAAGAAAAAUUCAAUUUCAAGCAAAGCAGCUUCUUCCUUUUUCUCAACCCAGGCCCAUGUGGCAUGUGAGCACCCAACUGGAUGGAGCAGCAUGGAGGAGCGCCAUCUGCUGCUCACCUUGGCAGGGCACUGGCUUGCCCAGGAGGACGUGGUGCCCUUGGAUAAGCUGGAGGAGCUGGAGAAGCAGAUCUGGCUGUGCCGCAUCACCCAGCACACUCUUGGAAGAAAUCAGGAGGAAACAGAGCCCAGAUUUUCUCGACAGAUCUCAACUAGUGGUGAACUUUCCUUUGAUAGUUUAGCCAGUGAGUUUUCCUUCUCCAAGUUGGCUGCUCUGAACACAUCAAAAUACUUAGAACUUAACAGCCUUCCAUCCAAAGAGACAUGCGAGAAUAGAUUGGAUUGGAAAGAGCAGGAGUCACUAAACUUUUUGAUUGGGCGCCUACUGGAUGAUGGCUGUGUGCAUGAAGCAAGUAGAGUAUGCCGGUAUUUUCAUUUUUAUAAUCCAGAUGUCGCCUUGGUAUUGCACUGCAGAGCACUGGCCUCAGGGGAAGCUAGUAUGGAGGAUCUGCACCCAGAGAUCCAUGCUCUCCUACAAAGUGCUGAGCUGCUUGAGGAAGAAGCACCCGACAUUCCCCUAAGGAGAGUCCACAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-334.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -356.2

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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