Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SWT1_0014700
Sequence Length
469 nt
GC Content
0.3710
CUAAUAAGGCAGUGGAUUUUACAACAGUCAAAUUCUUGCUUCAGGAUUCUAGAAGUUUGUUACAUGCUUUCAGUACAAGGUCAAAUUAUGAUGGUAUUCUUCCACAGACCUUUGCUCAAGUAAACAACCUCCUUCAGACAUUUGCAGAGGUCAAGACAAAACUUAAGCCAAAUUCUUCAGAAAACACAGUGACUAAAAAGCAGGAAGGUACUUCAUUGAAGAAUUCUCAUAAUCAAGAAAUCACUGUUUUCUCGAGUUCUCAUCUUCCCCAACCCAGCAGGCAUCAAGAAAUCUGGUCUAUCCUAGAGAGUGUUUGGAUUACAAUAUAUCAGAACAGCACGGAUGUAUUUCAAAGAUUGGGCUCAAAUUCAGCUCUGACUACUUCAAAUAUAGCAUCAUUUGAAGAAGCAUUUAUAUGUCUUCAAAAGUUAAUGGCAGCUGUGAGGGAUAUUCUUGAAGGAAUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-87.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.5
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....))(..((((((((..((((((....((((((.((.((((((((.(((((.(.(..(.((((((.(((.((..((.......(((((((...........(((((((((............................)))))))))(((......)))..))))......)))......))..)))))..)))))))..).).))))).....))))))))...)).))))))...))))))...(((((.........((((((...((((.(.(((.......(((((......))))).(((.((((((.....(((((((...........))))))))))))).)))(((((.......)))))(((((..(((((((........)))))))(((((((....))).))))...)))))))).).)))))).))))....))))).))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.....||(,,{((((((.,{...,||.,,,||||||||{,(((({(({.{(((({((((...(((((..((({.({{(((......{(,(((.......))}}}|||||||||}.}}}}}....|,,,,,,.{{,,...,}),}))))),.,|,....,}}}..}...,,,,{,,.{{{{{..{{{{(({,,.....,,,,{{|{|,.||||...}})),}))}),.......}},,.))))))))))}}.|||,,.......(((({{...((((.(.(({.......(((((......))))).{((.((((((....,{{{{{((.,.........))))))})))))).))}(((((.......))))),{,{{.,(((((((........))))))}|{{((((....))),)))),..,,},.})).).)))))).))))...,}}))}})))))))}..)
Back