Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TLK1_0002100
Sequence Length
570 nt
GC Content
0.3772
GUUCAAAGAUCACCCAACAUUAAAUGAAAGAUAUUUAUUACUUCAUCUGCUUGGUAGAGGUGGCUUUAGUGAAGUGUAUAAGGCUUUUGACCUUUAUGAACAAAGAUAUGCUGCUGUGAAGAUACAUCAGCUUAAUAAAAGCUGGAGAGAUGAGAAGAAAGAAAACUACCACAAACAUGCCUGCAGAGAGUAUAGAAUACACAAAGAACUGGAUCACCCCAGAAUAGUUAAACUCUAUGAUUAUUUCUCCUUGGAUACAGAUACGUUUUGUACAGUGUUAGAAUACUGUGAAGGCAAUGACUUGGAUUUCUAUCUGAAGCAACACAAGUUAAUGUCAGAGAAAGAAGCUCGGUCUAUUGUAAUGCAGAUUGUAAAUGCACUAAGAUAUCUCAAUGAGAUCAAACCCCCUAUUAUACAUUAUGAUCUUAAGCCAGGAAACAUCCUACUGGUAGAUGGAACAGCAUGUGGUGAAAUCAAAAUCACUGAUUUUGGUCUGUCCAAGAUUAUGGAUGAUGAUAGCUAUGGUGUAGAUGGAAUGGAUCUAACUUCCCAGGGGGCAGGCACUUACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-126.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -138.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 193.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...............((((.((((((.....)))))).((((((..((((.(((((((((((((((..........)))))))....)))))))).))............)).))))))...(.(((((((.....))))))).).))))...............))((......(((((((.....((((...))))........((((......))))((((((((.......)))))))).(((((.(((...(((..((((((((..(((((((.(((.((((....(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))...))))))).))...))))).....(((((...)))))...(((..(((((((.((((((((((((..(((((...........))))).((((((.(((.((..(((((........))))).)).))).)))))).)))))))).)))))))))))....)))....))))))))..)))....))).)))))))))))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,....{{{{(..,,..,,.,.{((({{.....))))}}..(((((((((({,(((({(((((((({(,...,,{{{{|||||}},,,,|}|||}}|.|....,{,{,,{{{{.{{{{....,}}},||||{{.....})))}||{|||||||..,,......,,{{|,,,.....,((((({{..}}.||||....,,,........((((......)))).,|||||,...,,,.},,)))))}||||{.{{,,,{(((..,,,|||}||{(((((,,.{||,||||,...(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))..,}}})}}).))..,))))}..,},|||||...)))})},,|,,,,{{,||||,||||,|{{{||,,,||||{......}}}},)))))}||||||,((,{{{,{(((,..{{{{..{||,,||||{|||{.,,,,))))))))),,)))}}))))})}}}})}))).}}))},,,,}))))....,,){||}}||}}},},,}..}))
Back