Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TLK1_0004400
Sequence Length
684 nt
GC Content
0.3757
GCUAACUGUGAUCUCAGACGGCAAAUAGAUGAACAACAAAAAUUACUUGAAAAAUACAAAGAACGAUUAAAUAAGUGCAUAUCAAUGAGCAAGAAACUUCUUAUUGAAAAGAGUACACAAGAAAAGCUGUCAAGCAGAGAGAAGAGUAUGCAAGAUCGAUUACGCCUCGGGCACUUUACAACAGUUAGACAUGGCGCUUCAUUUACUGAACAAUGGACAGAUGGUUUUGCAUUUCAGAAUCUUGUGAAGCAACAAGAAUGGGUGAAUCAGCAAAGGGAAGAUAUUGAAAGGCAAAGGAAACUUCUAGCCAAACGCAAACCUCCCACAGCUAAUAAUUCUCAGGCACCCUCUACCAAUUCUGAACCAAAACAAAGGAAAAACAAAGCAGUCAAUGGAGCAGAGAAUGAUCCCUUUGUUAGACCAAAUUUACCACAACUGUUGACUUUGGCAGAAUAUCAUGAACAGGAAGAAAUUUUCAAACUUAGACUAGGACAUCUCAAAAAGGAAGAGGCAGAAAUCCAGGCAGAACUUGAACGUUUGGAAAGAGUCAGAAAUCUUCACAUACGUGAGCUGAAAAGAAUAAACAAUGAAGAUAAUUCACAGUUCAAAGAUCACCCAACAUUAAAUGAAAGAUAUUUAUUACUUCAUCUGCUUGGUAGAGGUGGCUUUAGUGAAGUGUAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -146.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 91.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......((((((..((((((.......................(((..........))).............((((...((((((((.(((...))))))))))).....)))).........))))))..(((............))).)))))).....))((...(((((((((....((((....))))((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))...(((((....(((...((((.(...(((...(((.(((....)))...))).....))).).))))...))).............))))).......)))))))).))))))...............)))).)))))))).((((.((.(((((..(((.((..((((((.......(((((((..((.....))..)))...))))....)))))))).)))..))....)))))))))........((((.((.....(((((((((...(((((((.((..((((........))))..)).))))((((((..............((((.....))))))))))..................((((((.....))))))...))))))))))))......)).)))).)))))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{,...((((((..((((((....................,,.,((,.........},,.............((((.{.((((((((.(((...)))))))))))...,.)))).........))))))..(((............))).)))))).,}}.))((...(((((((((....((((....))))((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))}..(((((..,.(((...((((.(...,{(...(((.{((,,..})),,.))).....}},.,.))))...))).............))))).......,))))))).))))))...............)))).)))))))).(((,,((.(((((..(((.((..((((((.......(((((,{..,{|,...,...,,,,.}))))...,)))))))).}))..))....)))))))))........{(((.((.....(((((((((...{{{((((.((..((((........))))..)).)))|((((((..............{{{{.....)))})))))),.................,{(({{.....}}}},}..,))))))))))))......)).)))).)))))))))...))
Back