Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TLK1_0016000

Sequence Length

2243 nt

GC Content

0.3812

GUGCAAUGGAUGAGCUUCAUAGUCUGGAUCCAAGAAGGCAAGAGUUAUUGGAAGCUAGAUUUACUGGAGUUGCAAGUGGGAGCACUGGAAGUACGGGCAGUUGCAGUGUUGGAGCUAAAGUGAGCAAAAUUCUCAUCUUUAUUUGACAGUCUUUCUUUCUAUUAAAUGAUCUAAAAUAGUAUGUAAAGGAUUCCUACAUAACGUGCUUAACAGCAAAUGUAACUUUUAUAAUGUGUAGAAUAAGAUCAGUGUUCAUAAAUGCGUUUUUAAUGUAGUAUACCAUAUUUCAGGGGCAUUAUAAUACAGCAUAAUAUGUUUCAGGGAUAAAAAGGAGUUUGGUAGAUUGUACUGCCUGUCUCCCACUAUGUAGUUUCUUAUCCUUCCUGCCCUUAUUAUCCAUGGUCCUAUCUGUACAUCUAAUCCACAGUUUCUAACUGCUGCAUAAAACUUUAAUAGUGUAUAUCUUUUAGGCCAGGAGUCCUCAACCCCUGGGCCAAGGACCAGUACCAGUCCUGUUAGUAACCGGCCACACAGCAGGAGGUGAGCGGCAGGAGAGUGAGCAUUACUGCCUGAGCUCCACCUGUUUGAUUCAGCAGCGUUAGAUUCUCAUAGGAGCAUGAACUCUAUUGUGAACUGUGCACAUGCAAGGGAUCCAGGUUGUGCACUCCUUAUGAGAAUCUAAUGCCUGAUAUGAGGUAGAACAGUUUCAUCUCUAAACUAUUCCCCACCCAACCUCCACCUUCCCUCUUUUUUCAUGGAAAAAUUGUCUUCCAUGAAACUGAUCCUGGGUGCCAAAAAGAUUAGGUAUUGCUGUGUUCAGCCUUUCAGUGAUAGACCCAGAUUGUCUACCUCAAACUGUGAUGAGUUUUCAUGUACUUGGGCUCUUAUGGACCUUUGUGACCAUUUAUUUAGGAUGUUUUCCCAAGAGUACAAUUGCUAGAUCAUAGGGUAUGUAUAGACUGAAAUUGGAUAAAUACAAGGUUGCUAUUCAGAACAGUUGUACUAAUCUGCAUUUUCAGCGGAGUGCAUGAGUAUUUCUGUAUUUCCAUAUCGCAGAAACACUUGACACCAUCCACAUUCCUCAUUUAAGUAUAAAAUAUCUUCUUGUUUUACUUGUACCAUCAAUUAUUUUGAGCAUUUCUUCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGGGAGUCUCACUUUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCUCACCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUUACCAUGCUGGCCAGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCCACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCACGGUCGGCCUAUUUUGAGCAUUUCUUUGUAUGCUUGUUAGGUUGUUGGGAGUCUUAGAAAUUAUUUUAAUUCUUUGUCUGUUUUUAUAUUAGUAUUACUUUCUUUUUUGAACUGAUUUUCUCAUGUUUCAUGUAUAUUCUACAUGUUGAUUUCUUGUUGACUUCAUACAUCGUAAGUAACUUCUCCCACUUUGUCAUAUGUCUCUUACUUUGUUCAUGGUCUCUGUUGAACUGGAGUUGUGUGAAUUCAUAGCACAUUGAACUCUCUAAAUUUGUUGUAAUCAGUCUCACCAGUUUUUUGCCUUACGGUUUGUAUCUCCAAAGUUUUGACUAACUCUUGGUAUUUAACAGAAAUAAGCAUCACCAUUAACCAUUUGGGUCAAAUAGACCUUUUUGUAUUUUUAUAUUUAUAAGCUAUUUUACUACUAAUUUAUAGACACAUGAAUAAAAGUAUUAUGAAAAACAACUUUAUUAGAUAUUUUAAUAAGAAUUACCUUGUACAUCUCUUUGUAUCAGGUAAAUUUUGGCUCACAAACAUAAAAGAUGAAAGAGUACUGUGAUGUGUCCUUUGAGCAUAAUGAGGUGGUCCAGAAUAUGGUUGCAGAAUAUUAUAUGAUGCAGUCCUUACUGUGUUUUCUUUUUUUCCUUAGAAAUAUAUUGUUCAAUUCAUUGAUUCUUGAAUUUGAGAAAAUUCGUCUAGCAUUAUGUUACCUGAUUAUGUGAGAUUUUACAUAUAGUCAAUAUCACCACCAUCAGCUUCAGAGUCUAGACAUGCAACUGUUGGUGUUUAUAUUUUCUGAUUCAUCUAAUAAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-572.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -617.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 693.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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