Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TRIQK_0002500
Sequence Length
396 nt
GC Content
0.3914
UAAGAAAAAUCACCAAGAAUAUUAUUUUUGGUAUUUGGAAUUGAAUUUGCCAGGAAUGCAAGCACUGCUACCUAACUAAAGACCUUGGCUUUGGAAACAUCUUACCCCUUGGCAGCUCUCCAGAGUUUAGACUUGGCAGCAUCAAAGACACAACGCAAGCAAUAUGAAACAGAAAAACAAGUUGGUUGGAUAGCUGUCCUCCAUGCAGUCAUUCAUGAUCCAGGCUGUCAUCAUCUUCAUCACUCAUGUUCAGAGUUACCCUAGAGGUCAUCUCCAUUUCAUCCAGAUAAAUGAGUAUGCAAGGAACGUUUUUAUAGGCAUUUUGGAGAUCAAAGAUGGGUAGAAAAGAUGCUGCUACUAUAAAACUUCCUGUUGAUCAGUACAGAAAACAAAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-78.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -85.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 80.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........(((((((((...)))))))))...((((...((..((((((((...(((.....))).......((((((.......)))))).............)))))))).))))))((((((.....((((((((((............(((.((((.((...........)).)))).)))(((((((......((((........)))).....)))))))............((((.......))))(((((........(((((((......((..(((((...((.........))...))))).)).....))))))).......))))).....)))))))))).....)))))).((((........))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{......,,{.(((((((((...))))))))).,|((((...((..((((((((...(((.....})).......((((((.,....,)))))).............)))))))).))))))|(((((.....((((((((((............(((.((((.((...........)).)))).)))(((((((......((((.,......)))).....)))))))............{(((.......)))}(((((........(((((((....,,{{..{{{({,|.{{,{,....,.}}.,.))))).}),},..)))))))......,))))).....)))))))))).....}))))}.((((........))))...,,....}}
Back