Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0002700
Sequence Length
1461 nt
GC Content
0.4764
CCUCGAGCUGUGGCAGGUUUUCGAGGGACAGUUCGUUAUGCAUCAAUCAACGCACAUCGGAACAGGGAAAUGGGAAGACAUGAUGACCUUUGGUCCUUAUUCUACAUGUUGGUGGAGUUUGUGGUUGGUCAGCUGCCCUGGAGAAAAAUAAAGGACAAGGAGCAAGUAGGCUCUAUUAAGGAGAGAUAUGACCACAGGCUCAUGUUGAAACAUCUCCCUCCAGAAUUCAGCAUCUUUCUAGACCAUAUCUCUUCUUUGGAUUAUUUUACAAAACCAGACUACCAGCUUCUUACAUCCGUGUUUGACAAUAGCAUCAAGACUUUUGGAGUAAUUGAGAGUGACCCUUUUGACUGGGAGAAGACUGGAAAUGAUGGCUCCCUAACAACCACCACUACUUCUACCACCCCUCAGUUGCACACUCGCUUGACCCCUGCUGCAAUUGGAAUUGCCAAUGCUACUCCCAUCCCUGGAGACUUGCUUCGAGAAAAUACAGAUGAGGUAUUUCCAGAUGAACAGCUUAGCGAUGGAGAAAAUGGCAUCCCUGUUGGUGUGUCACCAGAUAAAUUGCCUGGAUCUCUGGGACACCCCCGUCCCCAGGAGAAGGAUGUUUGGGAAGAGAUGGAUGCCAACAAAAACAAGAUAAAGCUUGGAAUUUGUAAGGCUGCUACUGAAGAGGAGAACAGCCAUGGCCAGGCAAAUGGUCUUCUCAAUGCUCCAAGCCUUGGGUCACCAAUUCGUGUCCGCUCAGAGAUUACUCAGCCAGACAGAGAUAUUCCACUGGUGCGAAAGUUACGUUCCAUUCACAGCUUUGAGCUGGAAAAACGUCUGACCCUGGAGCCAAAGCCAGACACUGACAAGUUCCUUGAGACCUGCCUGGAGAAAAUGCAGAAAGAUACCAGUGCAGGAAAAGAAUCUAUUCUCCCUGCUCUGCUGCAUAAGCCUUGCGUUCCUGCUGUGUCCCGUACUGACCACAUCUGGCACUAUGAUGAAGAAUAUCUUCCAGAUGCCUCCAAGCCUGCUUCUGCCAACACCCCUGAGCAGGCAGAUGGUGGUGGCAGCAAUGGAUUUAUAGCUGUUAACCUGAGCUCUUGCAAGCAAGAAAUUGAUUCCAAAGAAUGGGUGAUUGUGGACAAGGAGCAGGACCUUCAGGAUUUUAGGACAAAUGAGGCUGUAGGACAUAAAACAACUGGAAGUCCUUCUGAUGAGGAGCCUGAAGUACUUCAAGUCCUGGAGGCAUCACCUCAAGAUGAAAAGCUCCAGUUAGGUCCUUGGGCAGAAAAUGAUCAUUUAAAGAAGGAAACCUCAGGUGUGGUCUUAGCACUUUCUGCAGAGGGUCCUCCUACUGCUGCUUCAGAACAAUAUACAGAUAGGCUGGAACUCCAGCCUGGAGCUGCUAGUCAGUUUAUUGCAGCGACGCCCACAAGUCUAAUGGAGGCGCAGGCAGAAGGACCCCUUACAGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-448.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -477.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 405.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((((((.((((((((.((.((((((......)).)))).))....(((((.(((..(((((((.......((((...))))(..(((((((......)))))))..)((((.((((...((.(((..(......)..))).)).(((((......)))))...(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))(((.((........)).))))))))))).)))))))..))).)))))...........((((...(((((((((.(((((((.((((..((((.((((.................(((((((.......(((......(((((.((.....(((((((((.....((.........))))))))))).(((((.((.(((.....((((..((((((..((((((..............))))))))))))))))...))))).)))))(((((....((((......((((((...))))))......))))....)))))(((((......)))))..)))))))......)))........))).))))(((((..((((......))))...)))))..(((((((.((....)).))..)))))....)))).)))).)))))))))))))))))))).))))((.(((......))).))(((..(((....))))))(((((.............(((.(((.......))).)))(((.(((((...))))))))....)))))...((((........))))..........)))))))))))))))))........((((((........(((.(((((...((((....)))).))))).)))))))))..((((.(((((((..((((((...((.((((...(((((((...(((........)))....)))))))((.(((.((((((((..............))))))))...))).))(((((((.(((....))).))))))).((((..(.((((...((((...(((.((((....)))).)))..))))...)))))..)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.((((((...............)))))........).))))).).)).))).))))))))))))((((.......))))...(((..((((.(((.((((..(((((((..((((((.....((.((...))))....)))))).......)))))))..)))).)))...))))..))))))).))...)))))).((((((((....))))))))..(((((.............)))))(((........)))....))).))))))))..((((...))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((((((((((((((((((((((.(({((,,.({{........,,)}),..||||{{({(((.,(({{,,(({((((.({((,.,||||.,|||{({,{.,.,{{||({|{{,.{{({((({({...((.(((..{......}..))).}}.{||{|,,.,,,))))),,,||{{{{{{{{{{|,,|,.|||.,,|||||{{{.,,|{|,,,...}}}.}}}}}}}}...}}}.|..}}|||||||}}||(({.,,........,,.)))},}}}}}}|||||},|,.}}}.})}||||....,}}.,(({{.,.{{((((((,,(((((((.((((..((((.((((,(((((,.(((...{{.(((....},,.}}.,,,))).,.))))).}}.....{((((((((,....{{.........)})))))))))...,,(((.{((({,{,.{(((.(((((((..(((((({............}))))))))))))).,}....|,.}}))),))).}....((((((((,,.{{{({{,,{|,|||{{{{.,,..(((...(({({(((((......))))),,))),,))).,)))))},.,.},,,))))))))(((((..((((......))))...)))))..((((({{.((....}).})..)))))..,,)))).)))).)))))))))))))))))))).)}})({.{{{....,.))),)}(({..(((....)))})),|}},}}}}},,,,,...|||}|||...,,.,|||{,,.(((.(((((...)))))))).,}}}||,},,.{({{........))))...,.},,..)))))))))))))))))........,(((((,,,,....(((.(((((...((({....}))).))))).)))}}|||}..((,.,{{{{{{{,|{{{{{{...{{.{{(((((((((((({{...{{..(((({...)))))}),,))||.,,,.((((((((,.{........,..)))))))).|,}|||||(((((((.(((....))).)))))}..((((..(,((((...((((...(((.((((....)))).)))..)))).,.))))),,)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.{(((((...............))))).,.....,).))))).).)).))).))))))))))))||||.,,....}}))...{((.,((({.{{{.{{||,,||{{{{,..{{||||.....{,{({...)))),}}}))))))...,,.,))))))),,}|||{|||.,,,|||{.|||||},.,,...,,,,,,.((((((((....))))))))..(((((.,,,......,,.)))))(((........)))....})))}))))),,,},|||},,)))}))))).
Back