Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0004400
Sequence Length
660 nt
GC Content
0.4576
CCUCGAGCUGUGGCAGGUUUUCGAGGGACAGUUCGUUAUGCAUCAAUCAACGCACAUCGGAACAGGGAAAUGGGAAGACAUGAUGACCUUUGGUCCUUAUUCUACAUGUUGGUGGAGUUUGUGGUUGGUCAGCUGCCCUGGAGAAAAAUAAAGGACAAGGAGCAAGUAGGCUCUAUUAAGGAGAGAUAUGACCACAGGCUCAUGUUGAAACAUCUCCCUCCAGAAUUCAGCAUCUUUCUAGACCAUAUCUCUUCUUUGGAUUAUUUUACAAAACCAGACUACCAGCUUCUUACAUCCGUGUUUGACAAUAGCAUCAAGACUUUUGGAGUAAUUGAGAGUGACCCUUUUGACUGGGAGAAGACUGGAAAUGAUGGCUCCCUAACAACCACCACUACUUCUACCACCCCUCAGUUGCACACUCGCUUGACCCCUGCUGCAAUUGGAAUUGCCAAUGCUACUCCCAUCCCUGGAGACUUGCUUCGAGAAAAUACAGAUGAGGUAUUUCCAGAUGAACAGCUUAGCGAUGGAGAAAAUGGCAUCCCUGUUGGUGUGUCACCAGAUAAAUUGCCUGGAUCUCUGGGACACCCCCGUCCCCAGGAGAAGGAUGUUUGGGAAGAGAUGGAUGCCAACAAAAACAAGAUAAAGCUUGGAAUUUGUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -191.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((.....(((((((((.(.((((((...(((..........)))...))...((((((..((((((((.((((.((((...)))).)))))))(((((.((..((((((.(((((((((....((.(((..(......)..))).)).(((((......)))))...(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))................)))).))))).))))))...))..)))))........(((((((((.....((..(((((((((.(((.(((........)))((((((.(((...((.(((....))).))....))).).)))))..)))..))))))))).))....)))))....))))(((.((((.....)))))))...)))))))))))..))))).)))))))))..))))).)))))(.((((((..(((.....)))....))))))...((((((((...((((((...)))))).(((((..(((...((((((((((......)))))..))))))))..))))).........))))))))(((((..((((......))))...)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((,.....)}}.,}))))).(({(((({{{..(((((.{((...{(((((({.,(((((((...(((.(((.((((.((((...)))).)))))))....,.(((((((((..(((((((({..,.{(.(((,,,......|..,}}.,,.(((((......)))))...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}{{{.,,...........}}},....((((((((({{{.{{{{,{(({{{.....,,.||||},|...}})}))},|||,,,|,..{((........)))})))).))))......}}}},,,,...}})))))})}.}))))))))),}}}{((((((((,,...{{..,.....,)}))))))))}...{((({.{....{({{{(((,(((((({..{((((({........,...})))))}))))))).......{{...)}))))))),...))))})))))))}))))))},.(((((({.....(((...(({(((((((......))))),,)))}}))).})))))),....))}.))))).}||,,,..((((......))))}}})))))...
Back