Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TTBK2_0006100

Sequence Length

911 nt

GC Content

0.4577

UUGAGAAAGAUUGGGGGUGGGGGCUUUGGAGAAAUUUACGAUGCCUUGGACAUGCUCACCAGGGAAAAUGUUGCACUGAAGGUGGAAUCAGCUCAACAACCAAAACAAGUUCUGAAAAUGGAAGUUGCUGUUUUGAAAAAGCUGCAAGGGAAAGACCAUGUUUGUAGAUUUAUUGGCUGUGGGAGGAAUGAUCGAUUCAACUAUGUGGUCAUGCAGUUGCAGGGUCGGAAUCUGGCAGAUCUUCGCCGUAGCCAGUCCCGAGGCACAUUCACCAUUAGUACCACUCUCCGGCUGGGUAGACAGAUUUUGGAGUCUAUUGAAAGCAUUCAUUCUGUGGGAUUCUUGCAUCGAGACAUCAAACCGUCGAACUUCGCUAUGGGUCGCUUUCCUAGUACAUGUAGGAAAUGUUACAUGCUUGAUUUUGGCUUGGCUCGACAAUUUACCAAUUCCUGUGGUGACGUCAGACCACCUCGAGCUGUGGCAGGUUUUCGAGGGACAGUUCGUUAUGCAUCAAUCAACGCACAUCGGAACAGGGAAAUGGGAAGACAUGAUGACCUUUGGUCCUUAUUCUACAUGUUGGUGGAGUUUGUGGUUGGUCAGCUGCCCUGGAGAAAAAUAAAGGACAAGGAGCAAGUAGGCUCUAUUAAGGAGAGAUAUGACCACAGGCUCAUGUUGAAACAUCUCCCUCCAGAAUUCAGCAUCUUUCUAGACCAUAUCUCUUCUUUGGAUUAUUUUACAAAACCAGACUACCAGCUUCUUACAUCCGUGUUUGACAAUAGCAUCAAGACUUUUGGAGUAAUUGAGAGUGACCCUUUUGACUGGGAGAAGACUGGAAAUGAUGGCUCCCUAACAACCACCACUACUUCUACCACCCCUCAGUUGCACACUCGCUUGACCCCUGCUGCAAUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-249.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -267.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((..(((((((((((((..(((((((..((((((((((..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))........(((.((......)).)))))))))))))((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).))))))).......((((((...((((((((((((.((((.(((.(..(((((.((((..((.(((.((((........)))).))).))...)))).)))))).)))..)))).)))..((((((((((((((.......)))))..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))..(((((.((((.(((((.(..........((((((.((((..(((.(((((..(((......)))......))))).)))..(((((((......))))))).)))))))))))))))))))).)))))(((((..(((.(((((((..((((..((((..(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))))))..................))))..)))))))...))).)))))..((((.((.((((.....)))).)).)))).))))))))).........)))).))..)))...))))))..........................))))))).))))......))..)))))((..(......)..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{({(..{((,(((((((((,,(,{,{(({(,....,,,{,{{((((((,,...{{{.,,,)))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).}.,.)))))))...,,.((((({((......)).,.})))))).}}},{((((((((((((((.((.{{(((((.(({.(((({.,.....,))))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))),)))))))}......({((((.,.((({((((((((.((((.(((.{..{{(((.((((..{(,,{(,{{{{,,,,....)))}.}}},}},},)))).)))}}|.)))..}}}}.)}}..((((((((((((((.......))))),.(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))..{((((.((((.(((({.,...,{.,,,,((({{(.({({,,(({.,((((,.{{(,,....}}}..,..})},,}.)))},,||||{{.,,,.,))))))).})))))))))}))))))))).))))}{((({..(((.(((((((..((((..{,,...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}|||.,,........,,.}}}}.))))..)))))))...))).})))}..((((.((.((((,...,)))).)).)))).}))))))))........,))))}}}..)))...))))))}}}}....,..}},}}.,,..,))).)))}}}},|||||{{{..,,..|,,}}{{..,}.,}}})},))