Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TTBK2_0009300

Sequence Length

479 nt

GC Content

0.4718

GGAAAGACCAUGUUUGUAGAUUUAUUGGCUGUGGGAGGAAUGAUCGAUUCAACUAUGUGGUCAUGCAGUUGCAGGGUCGGAAUCUGGCAGAUCUUCGCCGUAGCCAGUCCCGAGGCACAUUCACCAUUAGUACCACUCUCCGGCUGGGUAGACAGAUUUUGGAGUCUAUUGAAAGCAUUCAUUCUGUGGGAUUCUUGCAUCGAGACAUCAAACCGUCGAACUUCGCUAUGGGUCGCUUUCCUAGUACAUGUAGGAAAUGUUACAUGCUUGAUUUUGGCUUGGCUCGACAAUUUACCAAUUCCUGUGGUGACGUCAGACCACCUCGAGCUGUGGCAGGUUUUCGAGGGACAGUUCGUUAUGCAUCAAUCAACGCACAUCGGAACAGGGAAAUGGGAAGACAUGAUGACCUUUGGUCCUUAUUCUACAUGUUGGUGGAGUUUGUGGUUGGUCAGCUGCCCUGGAGAAAAAUAAAGGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-130.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -139.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 93.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(......)(.(((((....((((((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).....((.((...........)).))..((((((...(((((((((((...((((..((......))..)))).)))))..((((((((...))))).))).(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))......)))))))))))).))))...))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(......)(.(((((....{(({((((((((((((((((.((.{{(((((.(((.(((((.,.....,})))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))).....((.{,...........}}.}}..((((((...((((((.(.(({..{(({((((..,({,,{.{,||.,}}.,,.)))},}}|,,,,},}))}.}}}{((((.(((((((((((({(((.......)))}..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))...,.,,.(((((({(.((((((((,.,...{{..(.({..{{........)}..)).)..)})))))))).}}...)))))).}))))))))))))))))))))))))))}))}.})))))))))))).}}})...))))).)