Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0016000
Sequence Length
1450 nt
GC Content
0.3690
GUUAAAUGGAAACCACCCUUGGGAACUGGAUGCCUGUGUAGCUGUUCUACCAUAUCAGUGUAUUGCAAUGAGUGGGGGAGGAGAGCAGCUGGAUAUCCUGAGUGUUGGAAUCCUAGUGAAAGAAAGAUGGAAAGUGUUGAGAAAGAUUGGGGGUGGGGGCUUUGGAGAAAUUUACGAUGCCUUGGACAUGCUCACCAGGGAAAAUGUUGCACUGAAGGUGGAAUCAGCUCAACAACCAAAACAAGUUCUGAAAAUGGAAGUUGCUGUUUUGAAAAAGCUGCAAGGUAAGCCCUUUGUAGAAUAUACAAUUUAUGAUUUGUAUGUUAAUUUAUAAUUUAUUUGUAUCUUCCUGAACCUUAAUUACAUUCUUUAAGUACUAAUUGAAUGUACUGGUGUCAGCCGGGUAUAAAUACGCUGAGCAUUUUUCUCUUGGAAAUUUUAUAAUGAGUUAGUAGUAGUAGAAGUAUGUAAUUACUUAGAAUAAUUGGGCUUUGGGAGUUCUUUUUCAUGGAGUAAGGAUAAGAGAGUGUGAAUUAGCAGAAUUUUUACUGCUUCGGAAAGUAUUGUCAUAAGUCUGCUAUUUGCCUUUCUUUUUUAAACUACCAAUAACAGAUACCUCUGAGUUGUCUCUACUCAAGUCUUUGGAUGUUAAAUAUGUUUUAAUCACAGUAAGGAAGCUGCCUUCAAAUCACACUGCAGGAUGGAUUAAAAAUAAUACUGUUGAUUAUAUGUUGAUUCAUAUUAGCUUCAGUUUCAGAGAAUAACUGUUUCUGGCCCUGUCGUCAUUUUUGAAGUCCGUUUUACUACUUGGGCCCUAUUUGUUUUUAUUACAAGAAUGAAUAAUUUUUUUUCUGACAUGAAUCCAGUGGUAUAAAACCCUGAAUAUAUUGCUAGUUUGUGUUCACCUUUGUAUUCUCAGCUUAAUGACAUACUCUCUGAUAUUACUGAUGUUUAAAUGUUUGAUCUGAAACAAAAUUAAAUAGGGAUGAUCAUUUUCCUUUGCCCCAAGCGUAUCCAAGUUUCUCUACCAGUUGGCUCAUUUGAUUAGAGAAUGAUGCCAGUAAAAUUAUAGAUCUGUUUUUAUAGUAAUUUUUAGCUCAAACUUAGCAUCUCCACAACAUGGUAAAUCAGGAAAACAGUGGAUAGAUUAACACCUAUUGUCAAUACUGGAAAAAUAAAUAAUUGGAGAAGAAAGAAUAGGUAAAAGGAUGGCUCUUUCUUUUUCUGACCUUUUCUAUUUUCUCCACAUUUCUCUUGAGUUGUUGUUCUCAACUCAGUGGUGUAGAGGCUACAAACAGGUACAGCCAGAGCUACAUCUUCCUGGGUUGCACAGAUCCCAGGAUACCUGUUUUACUAUCAGCCAAGCCCAUGAAGGGUAUGUCAGCAUCAGCUUGGUGUGGAUAGUGCCACUUCACCUUUCUCCUACUUGGCUCCAAGGAGAUGCUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-388.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -412.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((..((((((((((...((.(((((.(((.((((((((((.((...(((.(((...))).))).....))...)))))))))).)))(((........))).(((...............)))..))))).)).....))))))))))(((((.(((((((((((..((((((((((..(((((((.(........(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))......((((((((......))))))))(((((((((........)))))))))...........(((((((((((..(((((((.....(((((((..............)))))))..))).))))..))))))))))).).)))))))(((((....)))))...........((((((((((.(((((((((((.((((((.((((((...(((((.((((((....))))))((((((..(((.(((((((.((((((.((((((......(((((((....)))))..))......))))))))))))))))))).)))..))).)))....((((.((...(((((.......))))).)).))))...((((((.....))))))((.((((..(((((.(.(((((((....((.(((((................((((..(...(((((......)))))...)..)))).(((((((.......))))))).))))).))....))))))).).)))))..)))))))))))(((((((((((.....)))))))))))...........(((((((((..(((((((((..........))))))))).)))))))))........)))))).))..)))).))))))).)))).))))))))))((((((.(((((......)))))...))))))(((((........))))).....))))).))))).)))))))))))....(((((((((((.......)))))).)))))....((((((((......)))))))).......)))))......(((((((((.....((((((((.((((....((((((((((........))))).....)))))..............(((((((((.((((.(((((((((((........)))))))...)))).)))).)))))))))........((((((((.......)))))))).(((((((.((((((......))..))))....))))))).(((((((.(......).)))))))..)))).)))))))).(((((((....(((((((((((((.((((((...)))))).)))).)))).)))))...........)))))))....))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((,.((((((((((...((.(((((.(((.((((((((((.((.,.(((.(((...})}.))),}}}.,,.,.)))))))))).))}(((........))).{((...,...........))}..))))).)).....))))))))))(((((.(((((((((((..((((((((((....{((({((((((((((((((.((((...}}}}.,.|||{{.||.,...((((((((.((((......)))).}.,.)))))))......((((((((......))))))))(((((((((........)))))))))...........(((((((((((..(((((((.....(((((((..{........}..)))))))..))).))))..))))))))))).)}))))))}}))}),)}}))...........}}}||((((((((.(((((((((((.((((((.((((((...(((({.,(((((..,.,}}}},((((((..(((.(((((((.(((((,{((((((.,,...({(((((....)))))..)}...,,.))))))))))))))))))).)))..))).)))....,|||.,||,,{((((.......})))),||,,,,}|,|{(((((.....)))))},,,((({..{((((.{.(((((((....((.(((((,{{{{{{{,..,{{{{,({{..|,}}||{{{,},,,,)))},..,}..}}}}.,(((({{.......})))))}.))))).))....))))))).}.))))}.,}})},}))))}(((((((((((.....)))))))))))........,,,{{(({{{{{,.(({((({{{.......,..|}}}}}}}}.}})))))))},,,....)))))).))..)))).))))))).)))).))))))))}|((((((.(((((......)))))...))))))|((((........})))).....))))).))))).)))))))))))....{((((((((((.......)))))).))))}....((((((((......)))))))).......)))))......{((((((((.....((((((((.((((....((((((((((........})))),,,..)))))..............(((((((((.((((.(((((((((((........)))))))...)))).)))).)))))))))..,.....{(((((((.......)))))))}.(((((((.((((((......))..})))....))))))).(((((((.(......).)))))))..)))).)))))))).(((((((....(((((((((((((.((((({...}))))).)))}.)))).)))))...........)))))))....))))))))))))).
Back