Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TTC3_0010400

Sequence Length

598 nt

GC Content

0.3963

AAAUGCACUCGGUGAUGGAAAGAGAGCCACUAUUCUGAAGAACACUUGGCCAAAGGGUCAUUAUCGUUAUUGUGAUGCUCUUUCUAUGCUGGGGGAAUAUGACUGGGCCCUGCAAGCAAACAUAAAAGCUCAAAAACUCUGUAAAAAUGACCCUGAGGGAAUCAAGGAUCUAAUUCAGCAGCAUGUAAAGUUACAAAAACAAAUAGAAGACCUACAAGGUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAGGUGGCGGAUGAGGCGUUGAAGGUAGAUGAUUGUGACUGUCAUCCUGAAUUUUCACCACCAUCAAGUCAGCCUCCAAAACAUAAAGGAAAACAAAAAUCUCGAAACAAUGAAUCAGAAAAGUUCAGUUCUAGUUCACCAUUGACUUUACCAGCAGAUUUGAAGAACAUCUUGGAGAAACAGUUUUCUAAAUCUUCCAGAGCUGCACACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-131.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -143.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 103.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......((.((((...........(((((((((((((....((((((((((....((.((((...((.(((.(((.((((((((.(((((((((....((..(((((((((........((((((((((.................((((((...)))..))).((((((......((....((((....)))).............(((((...))))).....))......))))))......)).))))))))....)))))))))..))))).........)))))).............((((((........))))))..))))))))))).))).))...)))).))....))))))..))))....))))))).....)))))).((((..(.((.((((((.((((((.......))))))....)))))))))..))))(((((((..(((..........)))....................(((((.((((........)))).)))))...))))))).....((((.((((((((.....((((((((....)))))))).)))).)))).)))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,......,|,((((.(((,,,{,..(((((((((((((....((((((((((....((.((((..,((.((,{((,.((((((({.{{((((({{....((..(((((((((........((((((((((.................,{{(((...)))..}},.((((((......((....((({....)))}.............(((((...))))).....))......))))))......)),})))))))....)))))))))..}}})},,..,|,..}}))),..........,,.((((((........)))))).,)))))))),}},)),}).,,,)))).))....))))))..))))....))))))).....)))))).{{{({{(,{,((({(((.((((((.......)))))).|,.,}}}))),},}),))||,||,}}}||{..........}},..........,,,.......(((((.((((........)))).)))))...}}},}}},.,},((((.((((((((.....((((((({....)))))))).))))}}))).)))).)))),)