Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TULP4_0011800

Sequence Length

2501 nt

GC Content

0.6242

UGACAGGAGCAUCUGGUGUCCCUGAGAACAGCCCACCUUGUACCGUGAACAUCCCUAUUGCACCGAUCCACAGCUCGGCUCAGGCUAUGUCCCCCACGCAGAGCAUAGGGCUGGUGCAGUCCCUACUGGCCAAUCAGAAUGUGCAGCUAGAUGUCCUGACCAACCAGACGACAGCUGUAGGGACAGCAGAACAUGCAGGUGACAGUGCCACCCAGUACCCAGUCUCCAACCGGUACUCCAAUCCUGGACAGGUGAUUUUCGGAAGCGUGGAAAUGGGCCGCAUCAUUCAGAACCCCCCUCCACUGUCCCUGCCUCCCCCGCCGCAGGGGCCCAUGCAGCUGUCCACGGUGGGCCAUGGAGACCGAGACCACGAACACCUGCAGAAGUCAGCCAAGGCCCUGCGGCCAACACCGCAGCUGGCAGCUGAGGGGGACGCAGUGGUCUUUAGUGCCCCCCAGGAGGUCCAGGUGACGAAGAUAAACCCUCCACCCCCGUACCCAGGAACCAUCCCCGCUGCCCCCACCACAGCAGCACCCCCGCCCCCUCUGCCGCCCCCACAGCCCCCAGUGGAUGUGUGCUUGAAGAAGGGCGACUUCUCCCUCUACCCCACGUCAGUGCACUACCAGACCCCCCUGGGCUAUGAGAGGAUCACCACCUUCGACAGCAGUGGCAACGUGGAGGAGGUGUGCCGGCCCCGCACCCGGAUGCUGUGCUCCCAGAACACGUACACCCUCCCCGGCCCGGGUAGCUCUGCCACCUUGAGGCUCACGGCCACUGAGAAGAAGGUCCCUCAGCCCUGCAGCAGUGCCACCCUGAACCGCCUGACCGUCCCUCGCUACUCCAUCCCCACCGGGGACCCACCCCCGUAUCCUGAAAUUGCCAGCCAGCUGGCCCAGGGGCGGGGGGCUGCCCAGAGGUCCGACAAUAGCCUCAUCCACGCUACCCUGCGGAGGAACAACCGUGAGGCUACGCUCAAGAUGGCCCAGCUGGCCGACAGCCCGCGGGCCCCCCUGCAGCCCCUGGCCAAGUCCAAGGGCGGGCCCGGGGGGGUGGUGACACAGCUCCCAGCGCGGCCCCCACCUGCCCUGUACACCUGCAGUCAGUGCAGUGGCACAGGGCCCAGCUCACAGCCCGGAGCCUCCCUGGCCCAUACCGCCAGCGCCUCCCCGUUGGCCUCCCAGUCCUCCUACAGCCUCCUGAGCCCACCCGACAGCGCCCGCGACCGCACCGACUACGUCAACUCGGCCUUCACGGAGGACGAGGCCCUGUCCCAGCACUGUCAGCUUGAGAAGCCCUUGAGGCACCCUCCCCUGCCUGAAGCUGCUGUCACCCUGAAACGGCCACCCCCUUACCAGUGGGACCCCAUGCUGGGUGAGGAUGUUUGGGUUCCUCAAGAAAGGACAGCACAGACUUCAGGGCCCAACCCCUUAAAACUGUCCUCUCUGAUGCUGAGUCAGGGCCAGCACCUGGACGUGUCCCGACUGCCCUUCAUCUCCCCCAAGUCUCCUGCCAGCCCCACUGCCACUUUCCAAACAGGCUAUGGGAUGGGAGUGCCAUAUCCAGGAAGCUAUAACAACCCCCCUUUGCCUGGAGUGCAGGCUCCCUGCUCUCCCAAAGAUGCCCUGUCCCCAACGCAGUUUGCACAACAGGAGCCUGCUGUGGUCCUUCAGCCGCUGUACCCACCCAGCCUCUCCUAUUGCACCCUGCCCCCCAUGUACCCAGGAAGCAGCACGUGCUCUAGUUUACAGCUGCCACCUGUCGCCUUGCAUCCAUGGAGUUCCUACAGCGCCUGCCCGCCCAUGCAGAACCCCCAGGGCACUCUCCCCCCAAAGCCACACUUGGUGGUGGAGAAGCCCCUUGUGUCCCCACCACCUGCCGACCUCCAAAGCCACUUGGGCACAGAGGUGAUGGUAGAGACUGCAGACAACUUCCAGGAAGUCCUCUCCCUGACCGAAAGCCCAGUCCCCCAGCGGACAGAAAAAUUUGGAAAGAAGAACCGGAAGCGCCUGGACAGCCGAGCAGAAGAAGGCAGCGUUCAGGCCAUCACUGAGGGCAAAGUGAAGAAGGAGGCUAGGACUUUGAGUGACUUUAAUUCCCUAAUCUCCAGCCCACACCUGGGGAGAGAGAAGAAGAAAGUGAAGAGUCAGAAAGACCAACUGAAGUCAAAGAAGUUGAAUAAGACAAACGAGUUCCAGGACAGCUCCGAGAGCGAGCCUGAGCUGUUCAUCAGCGGGGAUGAGCUCAUGAACCAGAGCCAGGGCAGCAGAAAGGGCUGGAAAAGCAAGCGCUCCCCACGGGCCGCCGGCGAGCUGGAGGAGGCCAAGUGCCGGCGGGCCAGUGAGAAGGAGGACGGGCGGCUGGGCAGCCAAGGCUUCGUGUACGUGAUGGCCAACAAGCAGCCGCUGUGGAACGAGGCCACCCAGGUCUACCAGCUGGACUUCGGGGGGCGGGUGACCCAGGAGUCCGCCAAGAACUUCCAGAUUGAGUUAGAGGGGCGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-956 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -995.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 661.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((.(((.(((.(((..(((((.............((((((.............(((((((.(((...((((.((...((........))...)).))))...))).)))))))((((((.(((......))).....((((((.(.((((.((......)))))).))))))))))))).(((.....))).((.(((.((((......))))...))).))...))))))((((....))))..((((((((((...((((((((...(((...(........)...)))..))))).((((((((..........)))))))).((.(((..(((((((((.((((..(((....((......))....(((((........))..)))..((((((......))))))..(((.((.(((((((.((..((((((((..((((......(((((.....((.......))....)))))......))))..))).)))))....(((((..........))))).....))))))))).)).))).)))..)))))).)))))))..))).)).(((.(((.(....).))))))....(((....))).....((((......)))))))....))))))))))((((((.....(((((((..(((((..((((((.((.(((((((..((.(((.(.(((((...........))))).).)))..))..))))..)))..))))))))....).)))))))))))....))))))..)))))....))).))))))...))))...))(.((.(((((((((...((((.(((.....(((((......)))))...((((.....(((((....))))).))))(((.(((((((((..((.((...((...(((((((((((.(((......)))..))).......))))))))...)).....(((((.((.(((.....))).))))))))).))))))))))).)))((((.....(((((((((((((((((.(((.(..........)))).)))))(((((((((.......(((((.....)))))((((.....((((((((....((((((.(((.....))))).....(((((((......)))))))......((((((((.....((((((.((((.((((..(((((..((..((((.(((((.(((((.(((((((..(((.((((((((.(((((((........(((((..((((((.(((((...(((((.(((((((.((.((.....(((((.........)))))....(((........)))....)).)).))).)))).)))))))))).))))))....))))).........)))))))..............)))))))).))).)))))))((((.......)))))))))))).(..(((((((((((((((.((.((((((((....((.((....(..(((((((((..((((.((((..(((((((((...(((((((.((.............(((((...((((.(((((...))))).)))))))))................((((..((((....(((((...((((.(((....(((...))).....)))))))..)))))..))))..))))............((((..(((((..(((........))).)))))..)))).......)).))).)))).............((((........)))).........)))))))))..)))).))))......((((((((.((.((.....)).)).))))))))....................(((((.....(((.(.((.(((((((.................))).)))))).).)))....)))))((((......)))).......)))))))))..)....))..))((((((((.(((...........)))...))))))))..(((((........)))))...)))))))).)).((((...(((((((.(((..((..(((((..((((....))))..).))))...))..)))..))))))).))))..(((((...........))))).....(((......))).((((...((((...))))...)))).((((.....))))))))))))((((........)))).)))))))..)...)))).))....))..))))).....))))..((((((..(((((......)).)))))))))))))))).))).)))))))))))))))))))).)))).((((((((.((((.(.((((.........)))))))))..)))))))).((((((((((.....))))))).)))))))))))).))).)).)))))))....))))...))).))))..))))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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