Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TXNDC16_0003300
Sequence Length
1438 nt
GC Content
0.3846
ACUGAAGUUGCUGAAGAUCCUCAACAAGUUUCAACUGUCCAUCUCCAACUGGGCUUACCACUGGUUUUUAUUGUUAGCCAACAGGCUACUUAUGAAGCUGAUAGAAGAACUGCAGAAUGGGUUGCUUGGCGUCUUCUGGGAAAAGCAGGAGUUCUACUCUUGUUAAGGGACUCUUUGGAAGUGAACAUUCCUCAAGAUGCUAAUGUGGUCUUCAAAAGAGCAGAAGAGGGAGUUCCAGUGGAAUUUUUGGUAUUACAUGAUGUUGAUUUAAUAAUAUCUCAUGUGGAAAAUAAUAUGCACAUUGAGGAAAUACAAGAAGAUGAAGACAAUGACAUGGAAGGUCCAGAUAUAGAUGUUCAGGAUGAUGAAGUGGCAGAAACUGUUUUCAGAGAUAGGAAGAGAAAAUUACCUUUGGAACUUACAGUGGAACUAACAGAAGAAACAUUUAAUGCAACAGUGAUGGCUUCUGACAGCAUAGUACUCUUCUAUGCUGGUUGGCAAGCAGUAUCCAUGGCAUUUUUGCAAUCCUAUAUUGAUGUGGCAGUUAAACUGAAAGGCACAUCUACUAUGCUUCUUACUAGAAUAAACUGUGCAGAUUGGUCUGAUGUAUGUACUAAGCAAAAUGUUACUGAAUUUCCUAUCAUAAAGAUGUACAAGAAAGGCGAGAACCCAGUAUCUUAUGCUGGAAUGUUAGGAACCGAAGAUCUCCUAAAAUUUAUCCAGCUCAACAGGAUUUCAUAUCCAGUGAAUAUAACAUCGAUCCAAGAAGCAGAAGAAUAUUUAAGUGGGGAAUUAUAUAAAGACCUCAUCUUGUAUUCUAGUGUGUCAGUAUUGGGACUAUUUAGUCCAACCAUGAAAACAGCAAAAGAAGAUUUUAGUGAAGCAGGAAACUACCUAAAAGGAUAUGUUAUCACUGGAAUUUAUUCUGAAGAAGAUGUUUUGCUACUGUCAACCAAAUAUGCUGCAAGUCUUCCAGCCCUGCUGCUUGCCAGACACACAGAAGGCAAAAUAGAGAGCAUCCCACUAGCUAGCACACAUGCACAAGACAUAGUUCAAAUAAUAACAGAUGCACUACUGGAAAUGUUUCCGGAAAUCACUGUGGAAAAUCUUCCCAGUUAUUUCAGACUUCAGAAACCAUUAUUGAUUUUGUUCAGUGAUGGCACUGUAAAUCCUCAGUAUAAAAAAGCAAUAUUGACACUGGUAAAGCAGAAAUACUUGGAUUCAUUUACUCCAUGCUGGUUAAAUCUAAAGAAUACUCCAGUGGGGAGAGGAAUCUUGAGGGCAUAUUUUGAUCCUCUGCCUCCCCUUCCUCUUCUUGUUUUGGUGAAUCUGCAUUCAGGUGGCCAAGUAUUUGCAUUUCCUUCAGACCAGGCUAUAAUUGAAGAAAACCUUGUAUUGUGGCUGAAGAAAUUAGAAGCAGGACUAGAAAAUCAUAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-366.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 414.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))((.(((((.(((((..(.((((((....(((((........)))))......(((((((((((...(((((....)))))...))))))((((..((((...((((((((.((((((((((((((((..(((((..((((((((...))))))))(((((....)))))..........))))).))))))).(((((((..((((..((((((((((((((((..((((((...((((((.((((.(((.((.((((.......((((((.((.((((......((((..(((((.....((........)).....))))).)))).....)))).))..)))))))))).)).))).)))).))))))((((((....))))))..((((........))))(((..((((((((............(((((((((.............((.((((((.((((((((.......)))))))).(((((((((((((....(((....((((((....((((((....(((((((..........((((((.(((..((((((((((((.(((((..((.(((...((((..((((((((((............(.(((((..((((((.((..............)).)))...)))..))))).)....((((((...((((((..........))))))......))))))(((.(.((((.....)))).)))))))).))))))..))))...)))..))..))))).))))))))........((((.....))))))))..))))))))).......(((((....)))))............(((((((.(((((((((((((((((.....((.......))....)))).))))))))))))..(((.....)))).))))))))))))))....)))))).))))))....)))....))))))))))))).....)))))).))...(((((.(((((..(((((((.(((....)))...)).).)))).............))))).)).))).)))))))))..(((((.((((.((((....)))))))).)))))............((((((((((......)))))))))))))))))).)))(((((((.........)))))))))))))..(((........)))((((((.....((((..(((((.....((....)).....)))))..))))..)))))).(((((((.....)).)))))........)))))))))).))))))..)))).))))))))))))))))..)).))))))))))..)))))))))((((((((..(((.....)))..))))))))....)))))).)..).))))))......)))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(....}}((.((({(.((((|..|.{(((((....(((((........)))))...,,.{(((({(((((.,.(((((....))))),..))))}}((({..({{(,,.((((((,{.((((((((((((((((..((((,.{((((((((...})))))))}.,{{.,{{|}},,,..,....,.))))}.))))))).{((((((..((((..(((((((((((((((({{((({{(,,,|{{(((.({((.(((,((,((({......,||||{{,{(|(({{......{{|{,,|{{((||,,..{.{..,,,|,|,....}}}||,}}}||,,,,)))).,,..}}})}|}))).}}.}}}.|||}.}||},|((((({{{{{{|||||,,,,,,....,,..)}))|||}.{{{||{|{..,,|..|,,,,{,,,|||||..,.,.,{{(({{((.((((((.((((((((.......)))))))){(((((((((((((....(((....((((((....{(((((....(((((((.....,,...{(((({{{{.,.,{{{((({{,,{|{|{{,..{{,({{...((((,.{((((({(((.....{{,...,|,(((((..((((((.((.......,......)).))).,}}},..))))}.,....(((((({,.((((((..........)))))).,,...)))))){{,,(.((((.....)))).))}}})))}}))))),.))))...)))..{((((({..,{((((((..{{.....}}..))))),}}}))))))).})}|,|||,,....(((((....))))).....,,,..,,|{{{,,{,{{(((((((((((((((.....{{.,,,...}),...)))).)))))))))))}.}}|}..,,.))))})}})))))))))))....)))))).))))))....)))....))))))))))))}.}...)))))).),.....,,,.(((((..,{{{{{{.(({....}))...,}.,.}})},............))))).}}.{{((({....))))}|,,||}||||,||{,..,,))))}})),)))))...,,,,.....((((((((((......))))))))))}})))))}.))){((((({.........))))))}}}|||}....,|||.......{((({{,.....,|||,.(((((.....{(....)}.....)))))|{||}||{|},,},.(((((((.....)).)))))..)}}}},))))))))))}})))))..)))).))))))})))))))))..}}.))))))}))),,))})}}}}}((((((((..(((.....)))..)))))))),,..)))))}.}..).))))))......)))...))
Back