Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZFR_0000800
Sequence Length
2908 nt
GC Content
0.4587
CCAGCAGCCAGCUUCGGGUGUAGCCUAUUCUCAUCCAACUACAGUUGCUAGCUACACUGUCCAUCAGGCUCCAGUAGCUGCUCACACAGUUACUGCUGCCUAUGCACCAGCAGCCGCCACAGUUGCAGUUGCCAGGCCUGCUCCAGUAGCUGUUGCAGCUGCUGCAACAGCUGCUGCUUAUGGAGGCUACCCCACUGCACACACAGCAACUGACUAUGGUUAUACUCAGAGGCAACAAGAAGCACCACCACCACCACCCCCAGCUACUACACAAAACUACCAGGAUUCAUACUCAUAUGUAAGGUCCACAGCUCCUGCUGUAGCUUAUGAUAGUAAGCAAUACUACCAACAACCAACAGCAACUGCUGCUGCUGUAGCUGCCGCUGCCCAACCUCAGCCUUCUGUUGCUGAAACUUACUAUCAGACAGCCCCCAAAGCAGGUUACAGCCAAGGUGCAACUCAGUAUACUCAAGCCCAGCAAACUCGACAAGUGACAGCCAUAAAACCAGCCACACCAAGUCCAGCUACCACUACUUUCUCCAUCUAUCCUGUAUCCUCCACCGUACAGCCAGUAGCAGCUGCGGCUACUGUGGUGCCAUCCUAUACUCAGAGUGCUACUUACAGUACCACAGCAGUUACAUAUUCUGGUACGUCUUAUUCAGGUUAUGAAGCAGCAGUGUAUUCAGCUGCAUCUUCCUACUAUCAACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCAGGCAGCAGCAGCAGCUGCUGCUGCUGCUGCAACAGCUGCCUGGACAGGGACCACCUUUACUAAAAAAGCACCAUUCCAAAAUAAACAACUGAAACCAAAACAGCCUCCCAAACCACCACAGAUUCACUAUUGUGAUGUUUGUAAGAUCAGCUGUGCUGGACCACAGACUUAUAAAGAACAUUUAGAAGGACAGAAACAUAAAAAAAAAGAAGCUGCAUUGAAAGCCUCACAAAAUACCAGCAGCAGCAACAGUUCUACUCGUGGGACUCAAAAUCAGCUACGUUGUGAGCUCUGCGAUGUGUCUUGUACAGGAGCAGAUGCGUAUGCUGCCCACAUUCGUGGUGCUAAGCAUCAGAAAGUGGUUAAGUUACACACAAAACUUGGUAAACCCAUUCCAUCAACAGAACCAAAUGUUGUUAGCCAAGCUACUUCUUCAACAGCUGUAUCUGCUUCAAAGCCGACUGCCUCUCCUUCAAGCAUUGCAGCAAACAAUUGUACUGUGAAUACGUCAUCAGUUGCAACGUCUUCAAUGAAGGGUCUUACGACUACAGGAAACUCGUCUCUUAAUAGCACAUCUAACACUAAAGUAUCAGCAGUGCCUACAAAUAUGGCUGCCAAGAAAACAUCUACCCCCAAAAUAAAUUUUGUUGGUGGUAAUAAGCUGCAGUCAACAGGAAAUAAAGCAGAAGACAUAAAAGGAACCGAAUGUGUUAAAAGUACUCCUGUCACUUCUGCUGUGCAGAUUCCUGAAGUAAAGCAAGACACAGUGUCAGAACCAGUCACACCUGCAUCUCUUGCUGCUUUACAGAGUGAUGUGCAGCCAGUGGGCCAUGAUUAUGUGGAAGAGGUACGAAAUGAUGAAGGAAAAGUAAUUCGGUUCCAUUGUAAAUUAUGCGAGUGCAGCUUUAAUGAUCCCAAUGCUAAGGAGAUGCACUUAAAAGGGCGAAGACACAGACUUCAAUAUAAAAAAAAAGUAAAUCCAGAUUUGCAAGUAGAAGUAAAGCCUAGUAUUCGAGCAAGAAAGAUUCAAGAAGAGAAAAUGAGGAAGCAAAUGCAGAAGGAGGAGUACUGGCGAAGACGAGAAGAAGAGGAGCGUUGGAGAAUGGAAAUGAGACGUUAUGAAGAGGACAUGUACUGGAGGAGAAUGGAGGAAGAACAACAUCAUUGGGAUGAUCGCCGCCGAAUGCCAGAUGGAGGUUAUCCUCAUGGUCCUCCAGGCCCAUUAGGCCUUCUGGGAGUCCGACCAGGCAUGCCUCCUCAGCCUCAGGGGCCUGCACCCUUACGUCGUCCUGACUCAUCUGAUGACCGUUAUGUAAUGACAAAACAUGCCACCAUUUAUCCAACUGAAGAGGAGUUACAGGCAGUUCAGAAAAUUGUUUCUAUUACUGAACGUGCUUUAAAACUCGUUUCAGACAGUUUGUCUGAACAUGAGAAGAACAAGAACAAAGAGGGAGAUGAUAAGAAAGAGGGAGGUAAAGACAGAGCUUUGAAAGGAGUUUUGCGAGUGGGAGUAUUGGCAAAAGGAUUACUUCUCCGAGGAGAUAGAAAUGUCAACCUUGUUUUGCUGUGCUCAGAGAAACCUUCAAAGACAUUAUUAAGCCGUAUUGCAGAAAACCUACCCAAACAGCUUGCUGUUAUAAGCCCUGAGAAGUAUGACAUAAAAUGUGCUGUAUCUGAAGCGGCAAUAAUUUUGAAUUCAUGUGUGGAACCCAAAAUGCAAGUCACUAUCACACUGACAUCUCCAAUUAUUCGAGAAGAGAACAUGAGGGAAGGAGAUGUAACCUCGGGUAUGGUGAAAGACCCACCGGACGUCUUGGACAGGCAAAAAUGCCUUGACGCUCUGGCUGCUCUACGCCACGCUAAGUGGUUCCAGGCUAGAGCUAAUGGUCUGCAGUCCUGUGUGAUUAUCAUACGCAUUCUUCGAGACCUCUGUCAGCGAGUUCCAACUUGGUCUGAUUUUCCAAGCUGGGCUAUGGAGUUACUAGUAGAGAAAGCAAUCAGCAGUGCUUCUAGCCCUCAGAGCCCUGGGGAUGCACUGAGAAGAGUUUUUGAAUGCAUUUCUUCAGGGAUUAUUCUUAAAGGUAGUCCUGGACUUCUGGAUCCUUGUGAAAAGGAUCCCUUUGAUACCUUGGCAACAAUGACUGACCAGCAGCGUGAAGACAUCACAUCCAGUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-850.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -902.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 735.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((.......(((((.((......))))))).......)))))).)((.(((((..(((.((((..(((((((((......)))))))))..)))))))...(((((((.((...((((((.((((((.(((((.(..(((((((((((((((...))))))))))))))).....).))))).......(((.......))).((((.(((....))).)))).)))))).((.(((...................))).))..............(((((..(((......))).)))))(((((....))))).((((((....))))))....................)))))))).)))))))..(((((.((((........)))).....((((((((.........)))).))))..........(((((((((((((((((((((.((((.((((.((((((((..((((((..((((((...(((........((((((..(((...))).(((((.((((((((((..........(((((((..((((((((.(((((.((((.((.((((((((((.(((.((......)).))).))).))))))))).)))).)))))....(((...((((((((((((.....)))....(((((((((.((.((((.((((..(((.....(((((((.(((.(((((.(.(((..(((((((((((((...)))))))))))))....(((((((((...((((....((((......)))).....))))...........(((...(((..(((((((..(((((...(((((........)))))..)))))..))....)))))..)))....))).(((.((((.....)))).)))....................((.(((........))).))........))))..)))))...(((((((....)))))))........))).))))))..)))))))..))).....))).)))))))).)).)))))))))((((.(((.((((((...))))))))).))))(((((((........)))))))........(((((((((((........))))).((((...))))..((((((((.(((...(((.((((...((((..(((.((((((((..(((((((.........(((((((((((.....))).))).)))))..(((((..((((((((.((((..((((((....)).(((((((..(((((.......((.((((((((((...((((((.......(((((((..((.......(((((..(((((....)))))..))))).......)))))))))((((((..........((.((((............)))).))........))))))((((...((((((((.((((.((((((..(((((((..(((.((..((.....))..)))))....)))))))))))))..))))..)))))))).))))..((((......))))...))))))....))))...((((..(.....)..))))...........(((....))))))))).)).......))))))))))))((.(((...)))))((((.......))))..............((((((....))))))..))))..)))).))))....(((......)))...)))).)))))............)).))))).)))))))).))).))))........)))).)))..)))))))))))))))))))))))))).....))))).).))))))))))))..))))))))))......(((((.(((((((((.(((.(........).))).))))))))).)))))((((((((((.....))))).((((........))))(((.(((.(((.......)))))).)))...((((((((.(((((((((.((((((((..(((((((.........)))))..))...))))).......))).)))))..(((((((((((................)))))).))))).....(((((((((((((...)))))))).)))))................)))).)))).))))......)))))......(((((((((....)))))))))..)))))((((((.((((((((((.....))).(((((.((((....))))..))))))))))))))))))...(((...((((((...((((((..(((((....((((.....(((....(((..(((.(((((((....((....))))))))))))..)))...)))))))..))))))))))))))))))))..))))))........)))...)))))).........((((((((.....((((.(.......).))))....))))))))....))))))..((((.......))))(((.((((((((.(((((....)))))....(((((((((.......(((((.....)))))....)))))))))....((........))(((((((...))))))).....)))))))).)))((((((((((....)))))..))))).......))))))))...))))))))))).(((((((((.((((((((((......(((.(((....))))))..))))))..........)))).))).))))))(.(((((((((......))))))))).)......((((((((.....))))))))...)).))))))))).....))..))))).)))))((((.....))))...)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((((((..({(({((((({(({{.....,,,,,,.....{{||||||.|((.,,(((,.(((.((((..(((((((((......)))))))))..))))))).,.|}|,|||.,,...,((((((((,(,..(((((.(..(((((((((((((((...))))))))))))))).....).))))).....}}}|}}.....})))}|||,.,|,}}}})))})),)})))....((.(((...................))).)}..............(((({{.(((......))).)))))(((((....))))).((((((....))))))....................}},,,,))}))))|||{.|(((..(((({..,,,,,,|||,,,,,((((((({.........)))).)))).......},})))}...((((((((((((((.((((.((((.((((((((..((((({..((((((.{,{{{........((((((...{{{..{{{.((,((.((((((,(((((.{({{.,.(((((((..((((((((.(((((.((((.((.((((((((((.(((.((......)).))).)))},)))))))).)))).)))))....(((.{,((((((((((,{{{,...{{,(,,(({((,....|,}}}||.||||},|,{........((((((((,(((.{.,.,((,,(((((((((((,,,.})))))))))))))....(((||{(((,.,(({....,|{{{......,}}}..,,..}}}...........(((...{{{..(((((,(,.(((({.,.(((((,,......})))).,)))))..,),...))))),,|||....}}}.(({.((((.....)))).}))....................((.(((........))).))........))))}}})}}}...{(((({{,.{{||||,||......,,||}.})}}))}})}}||}}.,||||,,,,}},,}}}}))}),})}}},))))))((((.(((.((((((...))))))))).)))).{{((((........)))))||.....||,{{{,,.(((((........))))).{{{(,,,|||},{(((((,{{.{{{.|.({{,((((...((((..(((.((((((((..(((((((..,......{((((((((((.....))).)))},)))}..(((((..{{{,((((.((((..((((,{....,},(((((({..(((((.......,......},....((({,{{{.........})))))...,,......,((((.{((({{.....,))},})).)))}..((((((((.((.............(((..,...{{,{..((((((((((...,,....,{{{({((.{((((...((((((((.((((.((((((..(((((((..((((((..{,.....},}})}}))....)))))))))))))..))))..)))))))).))))}.|(((.{{{.{|||,....,,)))}.}}).))}.}}},...,,,)))))))))).})))...,..))))).))))))))....,.......))))))))))))|{.((....})}))((((.......))))..............((((((....))))))..))))..)))).))))....{((......))}...}||,.}},}}.....,,,,},.))}})))).)))))))).))).))))...,..,,)}}),)))),)))}))))})))))),}))))))))}.,},,}}})).}.))))))))))))..,|||||||,,......{((((.(((((((((.(((.(........).))).))))))))).)))))}}}}|{((((.....))))}.((((........))))|{{.{((|({{,.,....||||}}.}}}.,,||{,,((({((,,({....||.}}})}}.{(({(((...,}},.,}},||....,,,,..,,...|,,,,}|,||||{..{((((((((((..,.........,}}.)))))).))))}....,|||{{((((((({...)))))))).)))))..............,.))))})))).,,))}}}),}))}))}...|.(((((((((....)))))))))|.||||}{{{|{||{||{{{{{{{...,,|||{{((((.((((....))))..))))|||||}|||}}}}),}.|||,,.{{{{{{,..{{{(({..(((((.,,.((((.....|,,....{((||{{(,({{{{{{.,,.|,..,.}}))}}}}}|||..}}}|||}},))))..)))))))))))))))}}.,}..))))))........}}),..)))))).........((((((((.....((({.{.......}.))))....))))))))....}}}}||..((({....,,,})))|||.|{{{{{({{(((((....))))).,..(((((((((.......(((((.....)))))....)))))))))....(((((,.{{...(((((((...)))))))....}).},))))).,,||||{{||{{....}}}}}|.))}}}...))},))))))))...))))))))))).{((((((((.(((({(((((,,,...{(({(((....))))))..))}))),,,,......)))).))).)))))|(,(((((((({......))))))))),}......((((((((.....))))))))...)).)))))))))......,..,,..,,)))))((((.....))))...))))}.,}))
Back