Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZFR_0004900

Sequence Length

429 nt

GC Content

0.4545

GUACGAAAUGAUGAAGGAAAAGUAAUUCGGUUCCAUUGUAAAUUAUGCGAGUGCAGCUUUAAUGAUCCCAAUGCUAAGGAGAUGCACUUAAAAGGGCGAAGACACAGACUUCAAUAUAAAAAAAAAGUAAAUCCAGAUUUGCAAGUAGAAGUAAAGCCUAGUAUUCGAGCAAGAAAGAUUCAAGAAGAGAAAAUGAGGAAGCAAAUGCAGAAGGAGGAGUACUGGCGAAGACGAGAAGAAGAGGAGCGUUGGAGAAUGGAAAUGAGACGUUAUGAAGAGGACAUGUACUGGAGGAGAAUGGAGGAAGAACAACAUCAUUGGGAUGAUCGCCGCCGAAUGCCAGAUGGAGGUUAUCCUCAUGGUCCUCCAGGCCCAUUAGGCCUUCUGGGAGUCCGACCAGGCAUGCCUCCUCAGCCUCAGGGGCCUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-98.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -107.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 81.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(.((..(((((((.((((..(.....)..)))).))....))))).))).(((((...........((((((((........((.(((...)))))((((.......))))..............((((((....))))))........((...(((.(((((((..(((.......((((...........))))........)))........))))))))))....))............))))))))..((((.........)))).(((.((((.(((((...((((((..(((.((((..(((..((((..(((.((..(((....))))).)))))))...))).)))))))..))))))(((((.....))))).((((........))))))))))))).)))((((...)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(.((..(({(({(.((((..(.....)..)))).)),,..)))}).))).((((((({{.....{(((((((((..,,....((.{{,...,}})}((((.......))))..............({{{{{....}}))))........||...(((.(((((((..,(,.......{((,...........,,,,...{{...,))........))))))))))....,}............)))))))).)|,,,....,,,,.}}},.(((.((((.(((((.,{((((((..{{,(((((..({(..((((..(((.((..(((....))))).)))))))..,))).)))))))..))))))|((((.....)))),.((((........))))))))))))).))){{||,..)))))))))