Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0006000
Sequence Length
1275 nt
GC Content
0.3129
GAAAAGAAACCUGAAUUUCCAUAUGUUUGAUUAAAUGAGUCUUAAACCCUGAAGUGUGGAGAGGACCAAUUGUGGCAGUCUUCUGUGUUAUAAAAACAUUUAAUUAGAAUCUCUCUUCAUUUAGCAUAACUAUAGAACCUUUUAGGUAAGAGUCUUAACAUGUGUGUUUCUGUAUAACUUAUCUUUCCAUUAUCUCCCAUCUCUUAUUCAGUAAGAUAAAUAGCAUCUUUUAAAGUAAUUCUGAUGAGGUAAAUUUAAAAUAUUCACUUAAUUGAAAGAUGAGAAAUAUUUUUAAUUAAAAAAACACUAUUACAAAAAUUACUUAACCUUAUAAUAAUUCUUUAAUAUCUUUAAUGUUGAUUUUUAUAUGUUGAAAGUCUUUGGAUGACUUUUUAAUUGCUAGUGCUUGUCAAAAAAUUAUUAAUUUGUAUGUACUGUUAUUUUUUUAUGGACUGAAAAAGGACACGUCUUUGCUGACCAUACAUGAUUUAUUUUGUUGUUCAAUAUUGAAUUUUCUGCUGCUUCUACGAGAAAUAGAAAACAGAUAUUAUUUCAAAUUCUUCACUGCAUGCCUGGUCAACUGUUACUUGCUCAGAUGUCUUUUUAAAAUAACUUUUAAAACUUACUAGGGAAUAGAGGAGAUAACUCUUGCCCUAUUUAAAACUAGCCUUGAUGAAAUUAUGCUGUUGCUGGAUGAAUUAAUACUAAUCUUUUCUCCUACAGAGAGCUGCCAAAAAUAUGACUAUGACUUUAUUUCAUUUAAUAUUUUAAUCAAUAUAAACUACUUUUUGUUUUUAUAAAUAAAAAUCUGUAUUUUUCAAAAUUUUUCAGGAAAAAACAGCUGAUGAGUCAAUGUAUAUUUUGAUUUACAUUUUGAAUACUUUUUAUUAUUCCUUCCAAAACAGACACUCCUAGAAUAUGCAGAGAAAUGGAAAACUUCAGAAGAUCCUUUACCUUUAUUGGAGGUAUACACAGUGGCUAUCCAAAGUUAUGUUAAAGCCCGACCUUAUCUUACCUCUGAAUGUGAAAAUGUAGCCUUGGUUCUGGAACGCUUGGCAUUAAGCUGUGUUGAACUUUUACUGUGUCUGCCUGUUGAGUUAUCAGAUAAACAGUGGGAACAAUUUCAGACACUGGUGCAGGUAGCUCAUGAAAAGCUGAUGGAGAAUGGCAGCUGUGAAUUGCAUUUUUUAGCUACUCUAGCUCAAGAGACUGGGGUGUGGAAAAACCCGGUACUGUGCACUAUUCUUUCCCAGGAACCAUUGGAUAAGGAUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -273.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........((((((((((((.(.((((..((...((((........(((.....((((.((((.......(((((((.(((((((...............(((((........(((((((((((..(.(((((........((((.((....(((((((((((((((..((((..((((((((((.((((...((((((..(((((....(((((.......)))))....)))))....)))).))...................)))).))))))))))..))))............))))))..................................(((((((.....))))))).....)))))))))(((((.......)))))..........(((((.((.((((..........)))))).)))))((((((((.....(((((((..(((((((.((......((((((..((((..........(((...((((((...(((((((...(((....)))...)))))))..))))))....)))...........))))..)))))))))))).)))..)))...))))....))))))))(((((((......(((((...((((.......))))..)))))))))))))).))))........))))).)..))))))))))))))))...............))))))).)))))))(((((((....((((.......))))...))))))).....(((.((((........)))).))).((((((((...((((...(((((((...((((..........))))((((((((........)))))))).)))))))))))))))))))..))))))))...)))..))))......))..)))).).)))))))..)))))....))(((((.(((((((.((((((.(((((((((((((......(((((((.........................)))))))....))))))..(((((...(((((..(((.....)))))))))))))...))))))).)))))..(((((((((.(.....(((((..............)))))...).))))))))).......(((..(((((((((..((...(.((((..((((((.((.(((((((.((....))))))))))).))))))..)))).)...)).)))))))))..))).......).))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,,,,....((((((((((((.(.((((,,({..,(,(({({....,(,,....,{||,,||||,,.....(((((((.(((((((....,{{{.......{{{((........(((((((((({.......,,.......,,(((((((((....{{,...,,||,........,,.,,........,((((((({.{{(((,,,,.((((((.......((((((....(((((((..((((.((((({{{{.{((((({{,,{((,,{{,,||},}}},.,))))))),)))),,.........,....,,,,,,,,.,{{{,..{{{{{,{{,,..|{{{||,..|||}|}||))}}.}}}}}.}||{((((((.......))))))}.,,,,{{.(((({.,,.(({{..,.......}}||||,|}}}||{{.{{{{{{,,,,..,,}}}}})|}})}.(((......)))}}}}||,||.....||||,,|,,|||||{|}},{((((((...(((....}))...))))))}.,))}}}},...}},,.....,,.,},,))))).))))...)))))))....))))))..{(((((({....}))))))})))))),)))),,}),)))))))))))))))).,,......,,,(((..((({...}))).)))),)))))))))))...,,.,}}},.,,,,....))))))).))))))){((((((....((((.......))))...))))))).,,,,,,,.,......{((((((((....))))))))}.((((,({{(((........,,,|}}}}}.}}}},||,((((((((........)))))))),},..,{{{{{...,,,,.},,))}}}}},...,}}..,,}}...,,,}},.)))).}.)))))))..)))))....))||||{|(((({{{{{(((((.{(((((((((({{.{,..,{{,{{{,..|||,..{,,....,.,,,,}}},}||}|},...,}}}}||.,(((((,,,,({(({{(,,..,}})),})|}|}}}}|,,{|||||||,||}||..,{{{{{{{|,|,,...|||||,||,....})),..)))}),|||,)))})))}}.....||{{{.,|{{{{{||||{||||,|..,|||,||||||||||{,,,|||}}.,}}}}{(({((,|........,)))))).}},})),}}}|||||,.||||,,,,,,,}))..))))})))))
Back