Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
AATBC:5
Sequence Length
4598 nt
GC Content
0.6142
AAGGAAGGAGGGUGACUGCAGAGACCGGCCCUGGGCAGCGGUACCAGGGGCACAGGGAGCCUGGCCCGGCCCAUUGUCACUGGAAUUCAUGCCAUGCAGACUUCUACAUCAAAGGGAAACAAGGUCAGGAGGGCCGAGGGGUCCACGGCACUCCGCACCCACGGGGCCAGGCUGGCACAACGCCCCAACGCUGCAAUCCUGGGAAGAGUCACACGCGCCCUCCCGGGACCCACGUGACCAUCAAGGGAGUGUGGAGGACACAUCCCUCGGGGGUGACGCCCCUGCAGAUGGAGUUUCCCCAUCUGUGCCACCCUUGCAAGGCCUGGGAAAGGCUGCGGGGCCAGGCGGCACCGGGCAAGCUGAGUGCCAGGUGGUGGUUGCAACACACCGGGCAAAUCUGAAACCAUGGGACGGACGAGCUGCACCCCUGGGAAAGAGAACAGAGGAAGGCCGGUUAUCAACGUCCUCCUGUGCCUCAGUUUCCAGAAACAAGCCAGACUCAGUGCCUCAGGGAGACCCCGUGUGGCCUCCGGAGAGCACGGGACCCGCCCUUUGUGCAGGUGAGGAAACUGAACCCCAGAGCAGUGAGGGACUGGCCUGGGGACCCUGGGCUCAGCCCUGGGCGCCUUCCCUCUGCCCAUCUCAGACGGGCACAGCCAGCACCGCCUCACCCCAACGCGCCUCCAGACUGGCCCUCCAGGGGCCCCCAGGCACAAUCCUCUCACUUUCUUCCUCAAGCCCCUGCCUUCCCCCUUCGCACUGUGACCCAGGGGCUGCUAGCAGCUGGGCUGGGCUCCAAAGCUUGAAGCUGCUUCUCCAGGUCUCUUUCCAGGGGGCGGCGGAUGGCUGCUCACUCAGGGACGCCAACACCAACAGGAAGGGACCCAUGCACGGAUCUGACUUCCCUCCCAGGCUCUGCCUUCACUCAAUGUCCCUGUGGGGCAGCUGGGGCUCCCGGCCGCCCUCCCCUGCCCACAGCCGUGAGGUUGCUUCCUAGGGUUCUGUUUUCCCCACAGUCGGAACUGAGGUGCUGGGAGGCUCCAGAAGAGGGAUGGGGUGGAGCAAGUGGCCUGGAGCCCCCCAGGGCAGACCCCAAAGAGAAGGGUCAGAAGUGCCCUCUGGGGCCUGGGCAGCUGGGGGGAGCCCACAAGCCUGAGACCCUGUGGGAGGGAAGCGCCCCCACCCCGUGGUAAGAAAGGGGCUGGUAGAGGCUCCUAUGUGGCUCCCUCUGUCCCCUCCCGACCUCUGGCCAGGCUUGGGAUAAUCCCUGAGUGGACACAGGCGCCACGAUGGGGUCUCGGGGGUGAGGGCUGAGGAGGCUGAGCCUCCAAGGACCCCAGGGUGCCUGUUCCCACUGCACACCCACCAGGGCACAGGGUAGGGAUAGUGCCAGGAGGGCCACAGCUGCAGGGUCCAUCCCAGGCCGUGGUACACAGGUAGAGGUGGGUGCCAGCCUUCGUGAAGCACCUGCAGAAGCUCCACUCAGGGAGAGAACGAGGCACUCGCCCAAACAGAUCCUGGGUCACACGGGGCAGCAAGAGAGGGUGGAGCAAGUGGCCUGGAGCAAAGGGUUGGAGGCCCCGGGGCGGCGCGUUCUCCCCCAAGCCCAUUCCAGGGCCAUGGGCACCCCCCAGAGGCAGCUGGUGGGACUGCAGCCAUGCAGGUCCUAGAGGGCAGGUGACAGGGGACGUGACAGAAGGGGACAAAGGGCCGGCAACAUCCCUGGGGGAGGCACAGAGAGGGCCAGACUGCCCUCGGUGGACUGCGGAACCCAGAACCCAACGGCCAAUCCUCCCCCUACUCCUCACCCACAGUAAGGGGCCAGGGCUCCAUGCAAUGAGAACCCACGGGUGAUGCCACACGGGGGAGAAGCCACGCGGGGGAGAGGCCAUGCAGGGGAGAGGUUACAAGGGGGAGAGGCUGCGGGGUGAGAGGUCACAUGGGGCAGAGGCCACGCGGGGGAGAGGCCACGCAGGGGAGAGGUCACAUGGGGGAGGCCACGCAGGGGAGAGGUCACAUGGGGGAGAGGCCACACAAGGGAGAGGCCAUGCAGGGGAGAGGUCACAAUGGGGAGAGGCCGCAGGGGGGAGAGGUCACAUGGGGCAGAGGCCACGCGGGGGAGAGGCCACGCAGGGGAGAGGUCACAUGGGGGAGGACACGCAGGGGAGAGGUCACAAGGGGGAGAGGCCGCAGGGGGAGAGGUCACAUGGGGGAGAGGCUACACAGGGGAGAGGCCGCACGCUGGGGAGAUGGUCCCUGCGGGAAGACUCCGAGGCAGUCUCCUGCAGCUCCUUCCGGCGAAUCCGGUUCAGGAAGUAAAACCAGCCCUGUGUAGAGGUAAGUGAUGCUUGUGGGGAUAAUCUCCGAGCAGCUCACCGCGGCGCUGGCCAUUGCCGUUCUCUUCACGGUAGAAGAGUCCAUUUGGGGAAAAGGUCCCCAUCAGAGAUGGAGAUGUUCCCUUUCAGACUCCAGGCUAUGGCUGUGGGGCCGGCUCCCUACCACGUGGGCUGGGGGCUGGGCACAUGCAUGCCCACUCCUGGGCCCUCUUCCUGGUAGGCCACAGCACCACACACACUGCAAACCAGGCCUCUUCUUCAUCCACCACCACCGUCCAGGCCUCAACAUCACCGCGUGGGGUCUUGUGCCCUCUGGGGGAACUUCCGGGCUAAUGAGGGGGGACAGUCCCCAUUACCGGUCUAUCUUUAUAAGGCAGUAUAUGCAACAGUGGAAGUUCUGUGAGACAUGUUCCAACCCCGGGGCUGCUGGCAGAACUGUCCCCAAACCCACCCUCGAUCCCACGGCCAGGAAGUGGGUCCAAAAUUGCCUGGCCAGGUCACACCCCUGCGUGAACCGCCCCACAACACCCAGGGCGCUGCCUGACUUGCCGUCCACCUCUCAGCCCCUCCCCUCACCCCUGCCGCAGCUGCAGGGCCUACCCUCGCCGGGGGCUGCUCCCUGCUUACCUCCCUCGCCCGUGCAAUGCCUCUACUUCCCGCAAGGCCUACCGGGAGAUGUUACAGGUCACGGUCAUAUUUGAGCAUGAGAAGCUCACGCAGAGAACAUUCUGGCUGAGGGAGAGGUCUUGGGGUUCAAGGCUGUUUCUUGGCUCUGCUCAGCCAUGCCAGGCAGGAAAAUGGGCACCUCUAGUGACCCAGGCUGGCUGAGAGCCUGCAGGGAAGAGCCUUUGGAACGUGAGCCACUGUGGGCUGGCAGGACUGCAACUGGCGUCUCCAUCUACUGGUACCGAGGCGAGGAGGAAAAAGCAGGGGGGCCCGGAGACGGCCCCUCUAAGUCUGUAACUCCAGAGCUGCUGCUCAGUCCCCAGAACGUCACCUCCGAGCAGAGCCUGUGACAACUGUCAACUGUGAAGCUGUGGCGUGGGUUGCUACUGAAGCUCUGAAGUCAGCGAGGACACAGCAUGUUUGUUCUAGACCGUUUGGCUGCGGGAGGAAGCUGUACAUGCACACACUCGCCUCACCACCCUGCGAGUCCACAGGCCCCUCCCCGGAGUCACCUCCAGGUAAAGGGGGCCCUGCGUCGGGACUUGCUCUCUGGGGCGCUGAGAUGCUCUACAAUGAGCUGUGCUGCAGUGCACGGCCGCCCGACUGUGCACCCGCAACGGGGAACUGAACGCUGCAUGAAGUACAUCUCCAAGUUGUUCUUUAAGAAGGCUUAGGGUCCCUGGAAGACCCUCGCCCACACCCAGCGUGGAGCGUUGUUGCUCACGUGGCCACACCUCUCGGGAUGGCCGUGGGUCUCCGUGAUGGGCAGGCGAGUGGAACCACAGGUGCUUCCCGUCCUGGUCACAAAGUCAGAGUGGCUGGGCCAAGUGUCCUGAGAAGAGUCACCUCCUGGGAUCCCAUCAGCCUGGCCAUAGCAGAACACCCAGACAGGGGCCCAUCCCCGAGGCUCAACUCAACGCAUGCAGCCACUGUAGAAAAGUCUGGAAAGUAGUUCUUCAACCGACUAGACAUGGUGAGCCCAAAACCCAGCCAUGACACUCCUAGGCAUCUGCCCCAGAGGAAUGAAAGCAUCCAUCCCCUGCAAACUCAUCCUUACACAGCAGCGUGACUCAAGACGGCCAAAGGCGGAAACACCCCAAACGUCCAUCAGUGGACAAACGGGCAGAUGCAAUGCACUGUCUGUACCGUGGGAUGUCACUCAGCCAUAUGAAGGAAAGACUCCAGUGUGGAUGAGCCCUGGAACCACGGUGCUGCGUGAUCCCGUAACACAUGGCCAGAACAGACACGGCCCGGAACCUGAGGCCGGGAGGAUGCGUGCAGGUGGCGGGGAGACAGAGGGGCGAUGGCCCAGUUUCUUUUGGGCUGAAAAUGGUCUAAAGUUGACUGUGGUGAUGGCUGUACAACUUUGAAUAUGCUGAAAACUCGAAUUACACACUUCAGUUGGGCGAACUGUACUCCAUGUGAAUUACCUCUCGAUGGUUCUCUCCUGGGCUCAGGCGCUUCUCCCACCUUGGCCUCCUGAGUAGCUGGAACUACCAUUCAUGUGCGGAAAUAAAACAACUCGGUCUCAAAAAAAACUCAACUCAAAACUCAGUCUCAAAAAUAAAAAAAUAAAAAAGUAAAAGAGGCUACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2010.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2084.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 1176.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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