Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
BAALC-AS1:13
Sequence Length
551 nt
GC Content
0.4882
GAGGGGAGAUGGAACCCUGAGCAGCCCAUGUACAUGGAAGAUCUUUAUUGCAGAGAUCUUCAAACCAGAGAUAUACAAGAAUCCCUGUGGAAAACCUCAUGAACUCAAGGUCAUGCAGAGACUUAGGGAAGAACUGGGACUGGCUUAUCAAGACUCUACACUACUGACCCAGGGCUUGGCAGUUUCUGUCCUAGAAAUCAGAACACGCAGCUCAUGCAUCACCGAGAAGGUGGUCAGCCUAAGAAGUGGUUCCCCACUCUUUGUUCUAAGAUAUUCCUCUCUCAGAAACCACGUCUGUUUUCAACUUUUUUUUUUUUUAGACAGUCUCACUCUUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGUGCAAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAGCGAUUCUUCUGCCUCAGCCUCCCAGGUAGCUGAGACUACAGGCGUGUGCCACCAUGCCCAGCUAGUUUCUUGUAUUUUAUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGUCCAGUAUGGUCUCAAACUGCUGAGCUCAGGCAGUCCCCCCGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-165 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -176.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.(((.....((((((((((.(((....)))((((((((((.....))))))))))......(((((((((..((......((((.(((((((((...(((..(((((((.((((.(((.((.(((..(.......).))).))))).)))).))....)))))..((((.((((((((((((.....((((((((((((.(((.....)))((((((.....))))))......((((.((((....))))))))))))))..))).)))......)))))))(((((((((...................((((.((..((...((((..((((((((.((((..((((((.((.......))))))))....))))))))...)))).)))).))..)))))).((((((..(....)..))))))...))))))))))))))....)))).((((((............)))))).))))))))))))..))))....))..)))).))))).....)))..)))))))..))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.((((.(((.....(((((((,{{,(({....}}}((((((((((.....))))))))))......{{(({(((({{((,{{{{((,({.,,,{((((({,.({...||}}|||.||,|,||}}}}}}.{,,((((({,,(((,...{{((,.....,,{{,,{|{{{{,|{({|{(({,(((((((.....((((((((((((.(((.....)))((((((.....))))))......(((,{((((....))))))))))))))..))).)))......))))))){{{({((((....................||||||.......{{||,,{{||||||.||{|}.||||||,|{...,,,}||}}}}})....}}}})))),,,)))),),,|,||....))})}((((((..(....)..)))))),,.|}}||||||.},,..}},)))},}})))))))}})))).,,.|||||,{,.}||||}}},.,|||||...,}..})))}))))),..,,)))}.)))))))..))),))))...
Back