Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
BAALC-AS1:2
Sequence Length
958 nt
GC Content
0.5125
CGGCGGCGGGACUGGCCCUGCGCCCGGGCACCGCCUGCGCUGCGCCGCCCGGCCUCACUCCGCGGCCCGCCAGGACCCGGCCCCGGUGAACGGGCUCGGGGUGCCGAGGUCCGGCUGCGGGGCCGGGAAGCCACCUCCACCUUGCCGUCUGUUACGACCCCCGAGGCGCAAGGCUGAGCCCCAUCUCGCUAUCCGGGUCCGGAGGGGUUCACCUUAGAAGGAUUUUUUGAAGCUCUUGGCGCUGGCUCUAAAAGAACCCACUUCCUUGCGGAUUUCAGGAGUCAAGAAUCCUUAAACGGAGCCAAUUUGCUUUGUAAAGCCAAUUGCCCAAGUGACUUGAGUUCGAAAGGAGAUACUUCCUGGACAACUGCUAUAAAAACAACAACAAAUACUUUUAUUAAUUCGGGGAGCCUGGUCACCAACUGGAUGCUCAGGGGAGAUGGAACCCUGAGCAGCCCAUGUACAUGGAAGAUCUUUAUUGCAGAGAUCUUCAAACCAGGAAACUGAGGCUAAAGAGUUUAGUAUUCUGCCAAGGCCAGCUAAUAGUUACAGAGCAUGGUUCCAAAUUCAGAGCUGUCGGAAGCUUAAGCCCAUGUGAUGAACCACGAAUGUGAUUUUACCUCAUUUAAGCCUUGCAGCAAACUCUGCCAAGCUGUCUCUACCAGGCCAGAAUUUGGGGCAGGCAAGAUUUUCAGCAUCCCUAAAAUCACACUAAGAAGAUAAACAUGGAAACAGCUUGGAGCUGCCCUACCCAUAGUGAGGUGGUACUGACUGGAAGACAGCUUAAACGAUUUGGAGAAAAGUGGAAUACAUUAAUCUCAGAAAACUCUACCACCUGUAGAAAGAGAGCUAAAAUGGAGACAACCACAGGCAGUCUAAGAUACGCUGAACUACUACAGAAAAUAAUGCAGCAUGAAGGAAUGCUGGAAGGAUCUUCUAAGGGUGUGAGGAUACAGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-322.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -341.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......)))))((.(((((...))))).))..)))))(((((((.....((((((((.....(((((((((((((((......)).))))..)))).))))))))))))))))))))..(((.((((((((((((.((((.............)))))))))..((((((((.........((((....))))))))))))(((((((((.(((((((...((((((((((((((((..............((((((.(((((((...((((((.............((.((.((((.((((....)))).))))))))...))))))))))))).))))))...(((((((((........((((((..............))))))...)))))))))((((((.....(((((.(((((((((.........)))))))))..))).)).....((((((((((.....))))))))))..)))))).......(((...(((((.....))))))))..))))))).....)))).)))))....(((((((((..((((((((((.(((((((((((((((.............((((((((((..........((((.((..((((.((((((...............)).)))).))))..))))))..(((.......)))..))))))))))............)))))).....)))).))))).))....(((..((.((......)).)))))..))))))))....)))))))))....((((.........................))))((((((......(((........((((..((...))..)))).......)))......)))))).........((((((......))))))))))))))))))))))))).)))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((....{{||,||{{.{||||...})))),}}.,)))))(((((((.....((((((((.....(((((((((((((({......}).)}))}.}))).))))))))))))))))))))..(((.((((((((((({{((((.............)))))))))}.((((((((.{(,.{{{...,,}},.,)))))))))))(((((((((((((((((...((((((((((((((({,,...{{{,.....{((((,.(((((((,,.((((((....,{{,,....|{,(,{((((.((((....}))).))))))}}...))))))))))))).}))))}...(((((((((........{{{{{,..............}}}}}}...)))))))))((((((.....{((((.(((((((((.........)))))))))..))).))...,,((((((((((.....))))))))))..))))))..,{{{{(((,..,,|||}}}}},)))),,,..))))))).....)))).))))).,,,{{(((((((..((((((((((.(((((((((((((((.............((((((((((..........((({{((..((((.((((((..,..,.........))}}))).))))..))))))..{{,.......,,,..))))))))))............)))))).....)))),})))).)),...((,.{((.((......)).))))}..))))))))....)))))))}|,..{(((.....)))}..,,,.{{{....}}},}},.((((((......(((.....,..((((..((...))..)))).......)))......)))))).........((((((......))))))))))))))))))))))})).)))).....)))
Back