Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
BAALC-AS1:29
Sequence Length
4160 nt
GC Content
0.4437
AGAAGCCCAAAGAGACAGUUUAGGGGACAUAAAACAGCAAAAAUGGAUUUAAAGGAAAGCCCAGUCAUUCACACUUAGAAGAAUUCCUGGACUAACAAUUCUAAGCCAAGGCAGCUGCGGCAACGUUGAGGCAGAAUCAAAACCUGGGGAAAGACCUUAGGUAUUCAGAACAAAACAAUCAGCAGGCGGGUCUGCGGCAUUCUAAGAACAGACACUGGCAGGAACAAAGGUUACAGAAGUGAAUGACUCUAAGAAUCAAGCAAGACAUGGAGUGGCAGAAAAUUAAAUUCUGAAUCCCUAAAAGACAUGAUGCAAAGAUGACCUCCUCUCCCAAGGACAUGUCCUCAUCCUGCGCUGACCGUGUGUGGUCAUUUCAGAAAAAGCGAACAAUGGAGAACCUGCUUGAAUGAUACUUAGACCUGGGACAACUGAAAGGAGUUGCACUUAUACAAUUCGGUGCAGUGGAGUCCCCUGGGAGGAGCCCCAGUCACACGGGAAGAGACAGUCACAGCUGUAAUAAAUGAUGGCUAGCAUGUAUCAAGCACUGGCCGAGUCCUCAGCAUACAUUACAUUACAGAAUUCAGUGUGCACCUCAACACUCUGGGGGUGUAUUUUAUAGGAGAACUGUGGCACAAAGAGGGGUUUUGCAAUCCCAAGAAGAGUCAGCGUUUGAAUUUUGAAUUUAUGUGCAAAAGAGACAAAUAUGGCUAAAGGGCAUGGGCACACUCUCUCUGGGUCCCCGUGUUAACGAUUUUAGUAGCUUCUAUUUAAAUGGUGCUCUUUCUCUAAGAAGAUCAUUGGGUAUUUUCUGAAAGCUUACAUAAUGGCUGGAAGCCCCCUGCCUCUGCAAAGGAACACCUGAUUCAGAAAAGUAAACACCAUAACAGCAACCCAUUCAUCAGCUGCCCAGACUCACAACCAAGCAGACAUGCAGCGACUUUCCAAAAACCCUCAUUUCUGGCAUUACAGCCUGUGGCAAUAACAGAGUUAAGGAAAGGUAAGUGAAACUCAGAGAGACACAGUGAGAUAAUUAUUCCUCACGCCUGUUAGAAGAACAUUCCACCGUCUCAGAAGAAGCCCUGUCUGAAUCUGAUUCAGCUGAGAAAACAACUCAGGCCAUGGUAGCUGCACCCAACUCUCUAAAUCAACAGUGACCUGUGCUGAAGGGAUUAAGGCAUCCCAACAUUCCUCAGAGCCCAAGGCAAGGAGAAUCCCUUAUGAAGAUGAAAUUGAUCUUCAAGCACCCUCUACCUUACUCUGCGUGAUGCCAUAUUCUUCCUGAAUCCCACCCAACUCAAGAGCAUGAUUUGCAUAAUAAAAUCUCUAAUACUUUGAUGAACAAAUGUUAUCCAAGAUACUUUAAAAACUGCCUUCACGGUGAGAAAUGAACUUAAUUCCAUUAAUUCAUUGUCUGUUCGUUAUUCUAGAAACAUUAUUUGAGUGUUCAGCAUGUGCUGAGCUAUUUAGAGAUGUUUCUGAGGGCUAGGACUAGUAACUGCAAAUCCUAUGCUUUUUUUUCUCUCUUCCACACUGCCUUGGGGAUUAAAGACAGUGGCUCUUAAAUCUGGCUGUGCUUCAAAAUCAUCUAGGACAGGAGUGGGCAUUGGAACACAGACACGCUCAUUCAUUUAUAUAUUGUCUAUAGCUGCUUUGGCAUUAAAAACAGAGAAGUUGAGUAGUUGCAAAAGAAAUCACGUGGCCCACAAAGCCUGAAAUAUUUACCCUCUGUCCCUUUACAGAAAAAGUUUGCUAACCUCUGAUCUAGGACCUCUGGACCAGCAGCAUCAGCAUCACUUGGAAGCCUGUCAAACAUGCAGAAUCUCAGGUCCACCCCAGACCCACGAAAUUUCACUCUCCACUGACCUAGAGAACAUGGAGACACUGCAGGUUUUCUAGCUGCACUCCCACUACCAAAUCAGAAGUGCCUGGGGUGGGACGUUUGUUUGAGAUUCCCCAGGUGAAUCUGAUAUGCAGCCACUAGGGAAGCAGAAAGAUGAGUAAGGUGAUUACUGCCAGGUCUUCCUAUGGGACGGCAGCACCAGAUUCUCCAGCUGCUAGGAGAGUUAGCCGCUAAAGGAUCACAGCUGAGUGCCUCUCCAGGCACUGCUCCUGUGGAAGGAAAUGACCUUACCCAAGGUCACACCUACUUGCUAGGGGAAGACUGCAUCCAGCGCCUGGCCGAUACAGGGUAAAAAGGCCCAGUCUUCUCAAUUGCUGAAUGGCCAUCCCAGCUCCAGAGCUCCCCAGGGCAUCAGCUGAAGCCCCUAUUACAACAGCCAUUCCACUCCUCCCUCUGCCCUGGACUGUGCCCCUCACCCUAUUAGAGAAACUGGGAUGCUGACUGAAUUAUUAUUACAUUAGAGAAUUAAGAAGUUUUCAUUAAUUUUUAGGUGUGAUGAUGGUAUCAUGGUUAUAUAUUAGUUUGAAGUAUAUGAAAUUGCUAAUAUUACACUAUUUCAACCUACAAAAAUAACAAAAUGGUCCAAUCUAAUAUCUUUUUGGUCCAAUCUAAUAGAUAUGGUCCAAUCUAAUAUCUUUUUUAAAGAGUCCCAGUUUAUUAGAGAUUCAUACUGAAGUAUUCAUGGAUGAAGUUACAUGACUUGUGGAAUUUGCUUCAAAAAUGUUUAAUUGGCGAAGUGGAAUGGAGGCAGAGAUGAAACAAGCUUUGCAAUAUGUUGAUAAUUGUUGAAGCUGAUGAUGGGUACAUGGAGGUUUAUUAUACUAUUCUCCAUAUAUAUUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAGCUUGAGAUAGGUAAGAGGCCCACAUCACAGGUGGUGUUACUAGAGCUCUCUCCAGUAAGGGUUUACCUCAGAGUCUGUUUCUUGGCUCUGUCUUUAAGAGUAUACAGUAUAAUAGCAGAGAUAAGUCACAAUCAUAAAUAAGAAAACUCAAAAGGGAGUAAGUGUCCUAAAUGGUGUGUGCUAUCAGGGAACACAUAACUGAAGCAGAAGGGCAGGAGCAGCAGGCUUUUGGGGUGACAGGUGGGCUGUGGGAUCAGGUGGGAUGCCCUUUGAGGCACCUGAUCCCAUUGCCCCACCCAUCACCCCAAAGGUUGUAUGGAGAGGCUGGAGAGAAAGCCUUGAAUUCCAUACUAAGACAUUUGUAUUCAGUAGAUAGUGGGAAAUCAUGAAAGGCUUUGAGUGGAAGAAUAACACAAUAAUGAUCCCAGCUGUACUUGGGAGUAUUUACCUGGCAAUAAUGUGAAGGGGAUUGGAGUGGGAGUGACUGGGGGUGUGAAGACUAGUCCAAAAGUUGUUGCAAAUGUCUAGGUGAAAGGCGGUGAGGACAGAAGCUAGCAAUCCAUGAAGGGGCUGGUGUACAGGAAAGACCACAGGGCUCAGAAUGAGACAGACCUGAGUUCCAAACCCCACCCCACUGCUCACAGCCCGUGUACAUUUAGACAAGCCAUCCCACCGCUCUGACUACCCCCUUCUGUAAAAUGGAAAUAACAGAGUUAGCUAAUAAAUCUGCAAAGCCCGGCACAUGCUGAGCACCCAAUUAAUGGAAGCCACACCAUGAGGUCGUAGCUGUGUUCGUUUGUGCUUGUACAUCAUCACUUAUCACCCCAGCAAGAAAGUGUGAGCCUGACUGCUAUGAAGACUGCCCUUGAAAAGUGAUUCUUGGAGGUAAUCGUUUAAUGAGGCCUCGGUUUCAAACAUGCCAGUUGUUUAUUGAGGUGCUUAAGCCUGAAUCAUUCCUCUUAGGAAGGGUGCACAGGCGGUCUCUGCUUCCAUUGUAACCGCUGCCAUGCCCUGUUGUCAUGGUGACCAGUUUCCCAAACUGCCCUGCUAUUUUCUGCAAGCCUUUCCAGUUUCUUAACGCCCUAAAGUCCACAAGCCCUAGAGACAGCAGCAGGUUGGGUUUUUUGAACUUCCACAGAAAACACUGUCAACUCUUUAAAUUUGCCAGUUGGCUGCGAGCUGCUUCUCCAACAGAAGCUCCCAGCCUGAGCAGCAGUGUGACCCUGCACAGCAGACACCCACAAAUGUUCCCACUAACUGGAAAUUGGUGCCAUGGAAUAUUAGCUGGCACAUCAGUCUCUGGCUGGCAUUAAUCUUGCAGGAAAAUAAGGCAGAAGACAAGGGAAUGUCCACCAUGCAUUUCACGUACACAGCACAGUCUGAAGUUAAAAGACCAUUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1217.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1296.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 1005.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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