Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
BAALC-AS1:4
Sequence Length
594 nt
GC Content
0.5589
ACUGGCCCUGCGCCCGGGCACCGCCUGCGCUGCGCCGCCCGGCCUCACUCCGCGGCCCGCCAGGACCCGGCCCCGGUGAACGGGCUCGGGGUGCCGAGGUCCGGCUGCGGGGCCGGGAAGCCACCUCCACCUUGCCGUCUGUUACGACCCCCGAGGCGCAAGGCUGAGCCCCAUCUCGCUAUCCGGGUCCGGAGGGGUUCACCUUAGAAGGAUUUUUUGAAGCUCUUGGCGCUGGCUCUAAAAGAACCCACUUCCUUGCGGAUUUCAGGAGUCAAGAAUCCUUAAACGGAGCCAAUUUGCUUUGUAAAGCCAAUUGCCCAAGUGACUUGAGUUCGAAAGGAGAUACUUCCUGGACAACUGCUAUAAAAACAACAACAAAUACUUUUAUUAAUUCGGGGAGCCUGGUCACCAACUGGAUGCUCAGGGGAGAUGGAACCCUGAGCAGCCCAUGUACAUGGAAGAUCUUUAUUGCAGAGAUCUUCAAACCAGGUAAGCCCUGCCAGCUUUUGUCCCUCCACUCCUUUCUCCAAUCCAGAGUUCCUUGCUGCCAAAGGAAGAAUUUGUGGGAAGAGGAAACUCUUCUCUCUCGUUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 145.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((..((((((((((.....((((.((.(.(((((..((.....))..)))))).)))))).((((((((((.....(((((((((....)))).)))))....))))))))))...................(((......))).)))).))))))(((.((((((((.........((((....)))))))))))))))...((((((((((.(..((((((((((((((.(((...)))..))).......)))....)))))))))))))))))))..(((((((......)))))))...))))........((((((..(((...((((((((.........((((((..(((((((((..............)))))).....(((((.(((((((.....(((((.(((((((((.........)))))))))..))).)).....((((((((((.....))))))))))..)))))))...)))))..)))..)))))).....)))))))).(((........((((((.......)))))).......)))((((((....)))))).)))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((..,(((({{((({...}||||,||.|.({|{({((({{.....{{|||||{.,,,,||{(((((((((({{...,,,}},}|}),.,))).))))))))))))))))))))..||.,......{{{{{..(((,.....}}}.,,))}))))))|||.((((((((.{(,.{{{...,,}},.,)))))))))))}},...((((((((((((,.{((((((({{,,{(,{{,...||}..},.,.,,,..}})}...)))))))))))))))))))..{{(({((,{,,,.||||,}}.,,)),),}}},.,.{({(((,,{{{...((((((((.........((((((..(((,,,{,,.........,,...,}}))).....(((((.(((((((.....(((((.(((((((((.........)))))))))..))).))...,,((((((((((.....))))))))))..)))))))...)))))..)))..)))))).....))))))))......,{{{{{((((((.,,....}))})),,,}}},,||((((((....))))))})})..))})))
Back