Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

BAALC-AS1:5

Sequence Length

736 nt

GC Content

0.5448

GCGCCCGGGCACCGCCUGCGCUGCGCCGCCCGGCCUCACUCCGCGGCCCGCCAGGACCCGGCCCCGGUGAACGGGCUCGGGGUGCCGAGGUCCGGCUGCGGGGCCGGGAAGCCACCUCCACCUUGCCGUCUGUUACGACCCCCGAGGCGCAAGGCUGAGCCCCAUCUCGCUAUCCGGGUCCGGAGGGGUUCACCUUAGAAGGAUUUUUUGAAGCUCUUGGCGCUGGCUCUAAAAGAACCCACUUCCUUGCGGAUUUCAGGAGUCAAGAAUCCUUAAACGGAGCCAAUUUGCUUUGUAAAGCCAAUUGCCCAAGUGACUUGAGUUCGAAAGGAGAUACUUCCUGGACAACUGCUAUAAAAACAACAACAAAUACUUUUAUUAAUUCGGGGAGCCUGGUCACCAACUGGAUGCUCAGGGGAGAUGGAACCCUGAGCAGCCCAUGUACAUGGAAGAUCUUUAUUGCAGAGAUCUUCAAACCAGAUGGCUCGCAGAGAUUGAGGAACUUGCCCAAGGCUACGCAGCUUGAUCUUCUAAGGGUGUGAGGAUACAGGCGUCAAAGACCCCGUGCUGAGACAGCUCCAUAACAACAUGCAGAUAUUUGGCAAUGAGGGUUCAGAAGAGGACUUGCUGUGGAGAAGAGAGAAAAGAGAUGGGAAGACUCUGUGAAUGAAUAGAGAACACUCUGCAAGCAUCCCAGUUCCUUUGGUUGCCCUGCAGUCUGCAGGUACCAGGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-262.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -278.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 182.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((((...))))).)).))((..(((((((.....((((((((.....(((((((((((((((......)).))))..)))).))))))))))))))))))))..))...((((.((((((.((((.............))))))))))(((((((((((...((((.....((((((.(((((((.((((....((((((....((((.(((((.(((((((......(((.((.(......).))..)))((((........))))...(((((((......)))))))..)))))...))))))).).)))))))))..)))).)).)))))))))))..((((................................(((((.((((((((.(((.((((.(((((((((.........)))))))))...(((....)))((((((((((.....))))))))))...)))).)))(((((((((((((((......(((...))).......))))))))).......))))))))).)))))........))))).((((...)))).............)))).....)))).))).))))))))..(((((...((((.(((...........((((.((......((((((......))))))..)))))).......))))))))))))((((...((((((...)))))).))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..({{(((((..(((.......)))..))))))}(((.((((((((({(,,,.||.((((((((((..,..(((((((((....))))}}))))..,,))))))))))..{||.((((((((((((((((((....,..((((((({{{,{{(({((((((((.({,.{{{.,,,,}},.,))))))))))}}}},..((((((((((((,.{(((((((,{,,{(,{{,...||}..},.,.|,,..}})}...}))))))))))))))))))..(((((((......)))))))..}}}}..,}))}{(((...}))}{(((,...(((({....})))),,,,,}}}........................,,},,....)))))).,,.(((...}}}{{(((.(((((((((.........)))))))))..))).}}.....((((((((((.....))))))))))..,.))))))))....,(((((((((......(((...))).......))))))))}},.)))))).)))).....)))},,...((((((((((((({....((.(((......))).))...)))))),})).))))),....,.,}.},.)))))))))..)))......({,.(((((,{,((((((......))))))....,))).....,.))))).}}|{{{((((.,,((((({...}))))),))))))})..