Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

BAALC-AS1:6

Sequence Length

1749 nt

GC Content

0.4385

CUGCGCUGCGCCGCCCGGCCUCACUCCGCGGCCCGCCAGGACCCGGCCCCGGUGAACGGGCUCGGGGUGCCGAGGUCCGGCUGCGGGGCCGGGAAGCCACCUCCACCUUGCCGUCUGUUACGACCCCCGAGGCGCAAGGCUGAGCCCCAUCUCGCUAUCCGGGUCCGGAGGGGUUCACCUUAGAAGGAUUUUUUGAAGCUCUUGGCGCUGGCUCUAAAAGAACCCACUUCCUUGCGGAUUUCAGGAGUCAAGAAUCCUUAAACGGAGCCAAUUUGCUUUGUAAAGCCAAUUGCCCAAGUGACUUGAGUUCGAAAGGAGAUACUUCCUGGACAACUGCUAUAAAAACAACAACAAAUACUUUUAUUAAUUCGGGGAGCCUGGUCACCAACUGGAUGCUCAGGGGAGAUGGAACCCUGAGCAGCCCAUGUACAUGGAAGAUCUUUAUUGCAGAGAUCUUCAAACCAGGAAACUGAGGCUAAAGAGUUUAGUAUUCUGCCAAGGCCAGCUAAUAGUUACAGAGCAUGGUUCCAAAUUCAGAGCUGUCGGAAGCUUAAGCCCAUGUGAUGAACCACGAAUGUGAUUUUACCUCAUUUAAGCCUUGCAGCAAACUCUGCCAAGCUGUCUCUACCAGGCCAGAAUUUGGGGCAGGCAAGAUUUUCAGCAUCCCUAAAAUCACACUAAGAAGAUAAACAUGGAAACAGCUUGGAGCUGCCCUACCCAUAGUGAGGUGGUACUGACUGGAAGACAGCUUAAACGAUUUGGAGAAAAGUGGAAUACAUUAAUCUCAGAAAACUCUACCACCUGUAGAAAGAGAGCUAAAAUGGAGACAACCACAGGCAGUCUAAGAUACGCUGAACUACUACAGAAAAUAAUGCAGCAUGAAGGAAUGCUGGAAGGUAUGGGGUCAGAGCAAGCUGAUGGAGGGUCCUUCAUUUCCAAGCCACGAGUACAGCAGGAUGUAAGGCUUAGUUCAUAAGAACAUCUCCUGAAAGACAAUCUCUAUAAAAACUGUUUCAAUAGAAAGAAUGCAAGAUGUAACUGUUUAAUAAUAGGACUGAUAUUUUAAAAAACAAAUGAACGUAAUAGAAGACUAGAUGGAUGUGCUUCUCAAAGUCCUCUCUGUGGGAGGCUUCAUCCUCACUCUAGAUGUGUUGCCUGUAGCAGCUGUUAUUGAUUACCCGCCCAUAGCCUAUCCAUACUUACUCAUCAUUCCUUUACCUACCAGUGGCAUCCUAUUGGAAGCACCUGCGACUUUCUUAGGGCUUUCUCUUGGCCAAGCAUUGGAAGGCCAGCAGUAUUGAAAAGUUAAUAGUCUUGGAAGCACUGGCCCUCAACUAAUGACAAAGAAAAAAUAUAAGAUAAAUUCCCCAGCUUCCUUGCCUCCUGAAUGGGUCAAGUCUGUGGUGUGUUCUACCCGUUUUUCAGAGGUCCCAUGUUUUAAACCCUAGCUGCUCAAGGCAAUUUCCUGAUCAUUGAUGUACUCUCUAUUGGCUAAUUUUUAGAUAAUAUGGAAUAUGCUCAAAAUAGGAUACUCAAAGAAAAAAUCAGAUGCCAAAAUUAUGUACACCGAAUGAGUUCAAUUCUGUAUAAGUGUGGACAUACACACAUCAAAAGAAAUAUGGAACAAAAGAUACUAAAUGUUUAUAGUGGUUAUUUCUGGGUGUUGAAAUUUUAAGUGAUUUUCCUUUUCUUCUUUGUAAUUGUCUCUAUUUUUCAGUUUUUUCAAUAUACCCUGUAUUUCUUUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-487.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -520.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 592.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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