Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

CASC9:11

Sequence Length

1156 nt

GC Content

0.3607

AGAUGGAAAUGCGGAAAUCACCGUCUUCUGUGUCGCUCAGGCUGGGAGCUGUAGACCGGAGCUGUUCCUAUUCGGCCAUCUUGGCUCCUCUCCCUCUUUAAAGUGAUUGCUCACUGAUGCCUUAUCUAGUUCUCUUGGUGAGGUCAUGUUUUCCUGGAUGGUCUUGGUGUUUGUGGAUGUUCAUCAAUGUCAGGGCAUUGAGAAGUUAGAAUGUGAUUUUGAAGAAAGGAGGAAAGAUGUGAAAAGUGAUUGGUCAGCCACAUUCAUGGUGUUGAGAAAAGAAUUUGCUUUUCUGGAACAUAGCCUGUGAUAGCAGAACAACACCUGGCAAGAAACAGGUUAUGUUUGGCUGGAGAGUCAUUGGCACUAUCAAGAAAUAUUAAAGUGUAGAUUUGAGAGAGGAGGAGAAAGACCCAAGCAAAAUUGAAAACCAGGUGGGACCCAGACAGCAGCAAAGCAAUGGAAGCAUGUAUUUUGGUCAAUAUAGAGUUAAUACACAAUUUUGCCCCUCUUCUUCUGAUCAUGGGACUCAUAUUACCAGUCUUCACAUUUCCUUUAAAUUCAGGAAUCAGGAAGAAUUUCCAGAGUUUGCAGAUGGACACAUUUGCUGCUUCCAUUCUAAACAUAAGUUAGAAGAACCUUUCAACUGGAUUCCAACUUUAAUAUGUCACAAACAUAAAAAAGAAAGCUAUUUCCUGGACUUUUCUUCAUUAGAAAUUAAUAGAUUGUCAAUUGGCAUAGGGAAAAGAUAAUCAACAGAUGCCAACCCCAAGUUAACAGAAAUGCUAAAAUUAUAAGACAAAGACUUCAAAAUAGCUAUUUUAAUUUUGCCUAGUGAGGUAAAUGCAAACAUGCUCACUAUGAAUGAAAACAGGUAAUCUCAGCAGUCAUGUAAACUAUAAAAAUAAGCAAAUAUAAAUUUUAGAAUUAAAACACAAUAUCUAAAAAUAAAUUCACCUGAUAUUCUCAAUAGAAAAAAUGGUAAUGCAGAGAAAAAUGUAUGAAAAUAUGGCAAUUUGAAGAAGAGAGAAGAGAUCAAUAAAAUAAAUAAGUAUAUCCUUGGAGACCUGUGGAUGUUUUUUGAAAAGUGAAUCAUGUAAGUAAUUGAAGUCCCAGAAGAAAAGAAAAGAAGAGGAUGAGCAGAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-274.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -296.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 245.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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