Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
CDKN2B-AS1:27
Sequence Length
689 nt
GC Content
0.4485
GCGACAUCUGGACACGGCGCGGCGCUGGCGCUGCCGGAGCUGUCGACCCGGCCUGGCGCCGGACUAGUGUCCCUUUUGAUGAGAAGAAUAAGCCUCAUUCUGAUUCAACAGCAGAGAUCAAAGAAAAGACUUCUGUUUUCUGGCCACCAGAUAUAUGUUAUCUGUGCUUAAAGAAUUGAAAAACACACAUCAAAGGAGAAUUUUCUUGGAAAGAGAGGGUUCAAGCAUCACUGUUAGGUGUGCUGGAAUCCUUUCCCGAGUCAGUACUGCUUUCUAGAAGAAAACCGGGGAGAUCUAUUUGGAAUGUAUCUAACUCCAAAGAAACCAUCAGAGGUAACAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGACUGGUCUUGAACUCUCGACCUCGUGAUUCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGACACCACACCCGGCGGAUAGAGAGAAUUUUGACAGGAUGAUUACGGAGCUAGGAAUUUCCUACGAAGCUGGGUGAUAAAAGGACAUUGGACAAAAACACAGAUAGCUUCAUUCUAUACCAGGAUCCAUCACUGAUUAGCUGUAUUAUAUUUGUCUCUACUGUAAUUUGAGGAGAAUGAUACCUGCUUCUCUAUCUUGUUGGGUUUUACAGAUGAUGUAUUGAAAGUUCAAUAAAAUCUAUAAACAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-204 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...((((((((..(((((((((....(((((..(....)..))))))))))))))..)).)))))).....(((((((((........(((((((..(((((.(((((((.((........)).)))))))(((((((...((((((.....)))))).)))...))))................((((.((.(((..(((((...((((((((((.((((.((((....)))))))).)))))))))))))))..))).)).)))).............((((((((.((((...)))).))))..))))......(((......))).((((((((((((((((((.((((.(((.....)))))))...)))))))....(((...(((((((.((....)).(((((......))))).....((((((......)))))).)))))))...)))....(((((((((((..........(((((...))))).(((((((.(((......(..(...)..).....)))...)))))))(((((.....))))).)))).))).)))).............)))))))))))...))))).)))))))......)))))).))).))))).((((...((((....((((((....))))))..))))..))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,.((((((({{{{((,,{((((((((,,,,(((((..(....)..)))))}}))))))),.}}.}})))|(({(((((({(,(({,,.....,,})))}..|||,..{((((((.((........)).))))))}{((((({.,.((((((.....))))))})))...}))}.,,.........}})))}||}((.{({..(((((...((((((((((.((((.((((....)))))))).)))))))))))))))..}}}.}}.}||{{{...})}},.,,|||||{,|,,.{(((((..,,.....,,)))))},,...,{{{{(((((.,,(((,(((((,((((((..(({...|}}..})))),)))}}..)))....))))).}}||,||||,||}..,}}.(((({......))))).....(((((,..}}}}),,|||{||||((((((({|......,,((((((({{,..,,.,.(((((...))))).(((((((.(((......{..,...|..,.....}})...)))))))..,,,...,}}}))),)))).))).,}|{{.{{{{{{{..,,,|||||,|,,......)}))))})))))))..}))))))))))}})))))))....)))))).},{(((((....)))))}................
Back