Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
CDKN2B-AS1:29
Sequence Length
4826 nt
GC Content
0.3730
CUUUUGGCACAAGUAUUCAUUAUUAAUGGAAAUGCAUAGUAUUAUCUCAGCAAAUGUACAAAUAGUUUAGCUUCACUAAACUAGUCAAUUUUUUUUUUCUAAACAUCAAUGCUUAGGAAGCAAAACAGGCUGGGGGAACAGUAGUUGUACUGGUGGCAGCUGUGGUGCUGAUGGAGGAAGUGGUGGAAUGCAUAGGCUGCUCAUGCUUUUUGCCACAAUGAAGGUCAAAAAGUAGAUCACUUAAAGUCUAAAGUUAACCUUGGGGGUCAUAUUCUUCACCAAAAACUAUGUUUAUACAUAUAGACUUAGCAGUAUGCUAUAAAAGUGAAGAUAUAGCACUAUAAAAUUCCACCAUAAAGUAAAUUGUUCAAGAUUGUGGUCCAAGCUCUUCAAAAUGCUCAUAAAUCAGAAGGUGUAUUUAUUAAACAAUAUUUUAUAUGUACCUAUAAUAAUACAAUACUAUACUACACAAAUUGGACCUAAAAUGAAUUCUCUUGCUAUAUUAAAUAUUAAACAUUAAAUAGGCAGAAAUUUUGUUUGCACUGGACUUAGAAUAUAAGAAGAAAAUUUGGGACAACCUGAAUAGUUGAGGUCUCUUGAGAAACCCUUCAGCUUCUUUUCCUCCAAAUAAAUUUCUCUGUAGCAAAUGGAAGCCAUCCAAAUGAUUCCCUAGCUACCUCAAAGUACUGUAAUUUGUCUACUUCACAAAGUGGAGGACUAUAUCUAGCAAUAAUUCAAGAAAAAUGCAGUGACUCCCAUUAUAUCUUAGGCACUAUGCUAGGAAGUUUAUGCAUAUCAUUUUGUUUGAUUUUAAUAGCAACUUCAUGAAAUAAAUCAUCAUAAUAAAUCACUAUUUCAGAUAUUGAGAAACCACAGAAAGAGAGAAGUUAAAUAAUUUUCCUGUCAAAGACCACAUCAAUGAUGAAGCCAGAAUUUGAGCUCAUGUACUUAACCACUGGACUACCUGCCUGCCCUGUCGAGGAACAGCUAAGGUUGUCAUAGAGUCUUGACUGUGUAUAGAUAGUUGUUUGAAGAGAGAAAAAAGGCAGGAGGAUCUGGGGCAUAUGUUUAAAUCAGGCAUUGGCAUCUGUACUAGAAUUGAAAGGUGGAACUAUUAUUGUGUUCUAUUUAUUGAGUAUAGGUAUACCAUAUUCAAUGUAUUUCUCUGCUUCAUACACUAUCCAAGGUGAUAAAAGUGUUUAUGAAGAGGGAUUAGGAAAUAUCUGCUGUGUUUAGGUCAUAGUCCAACCAAAGGAUUAAUUAACAUUUGCCUCUUUUUUCUCCUACAUCCAGUGUCCCUUUUGAUGAGAAGAAUAAGCCUCAUUCUGAUUCAACAGCAGAGAUCAAAGAAAAGACUUCUGUUUUCUGGCCACCAGAUAUAUGUUAUCUGUGCUUAAAGAAUUGAAAAACACACAUCAAAGGAGAAUUUUCUUGGAAAGAGAGGGUUCAAGCAUCACUGUUAGGUGUGCUGGAAUCCUUUCCCGAGUCAGUACUGCUUUCUAGAAGAAAACCGGGGAGAUCUAUUUGGAAUGUAUCUAACUCCAAAGAAACCAUCAGAGGUAACAGGUAGGAGAUAUGAAACGACCUUUUAGAUAUGAACCCUAAUUGAAUAAAAGUUGCCAAACAACUGUUCCCAAACAUCUAAAGAAGAGUUUUAGUCUAAGUGGAAUGGCUGGAGAGUAUGGGAAGAGUUCUUUCCUACUCUGUCCAAACACAAGCCUCUGUGACAUUUAUCAAAGAAAUGCAGCCCUUUAAAUCUGGGUAUAAGUCCGAAAGGUGCUUUCCUUGUGAAGCUUCUUUUGUCCUCUGCUUUUAGGACUCUCUGCACACUGCAUCCUCUAUGUCACCCUCCAGUACAUCUGCUCUUACACAAGGGGCCCCACAGGGACUGGCCCACACACCAGCCAGGGCACAUGGGCCAACUUUUAACAGCAAAAGGAAAUGCUAAAUCCUAGAGUAGGGCAGAUGAGAAAAAUGGCAUUCUUCUUUAAGGGGCCCCCUGAGCUGAAAAUGAAAGAGACAUUUUGUUGCUUCUGCUACCUGCUUAUCGUCCAAUCCCAAUCUCAGAUUUUCUUUUUCUAUUUUUUAAACCCGAGUAGCACUUUUCCAACUAGUGUGUAGUUUUUCUUUCAAUUCUCUGCUCUUCACAGUAAUUAAACAAGAGCUAGCCUCCUUUUCCAAAUCUUGUUUUUGUAAUACCUUUAUUCCCAAAGAGUUAUGCUUAUAAGAGUAACAUAAAUGUGUUAAACUUGGUAUUGAUUUGAUGAUUUCAUAAACCCCAGACUCCUUGAAAUUCUGCAGGUUUUUGUGAAAGGACUUGCUUAAAAUCUUUGCUAAUCUACCUGAAUUUUCUUCCAAAGGCAGUUAUAUACAAUGUUUCUUAAAACUAAUUCUCCAAAUUUGCAAUUUGGCAGCAUCCUACUGGGACUCUAGAAGGCUGAUAAAUCAUGGAGAGUAGGUAUUCAUAUAGGAACUAUGAAAGCUGUAUGUAGUAAACACUACUUAAGAAGGCCUUACAUUUCAUAAAAAGUUGGAGAUUUUUGUGGAGACUCAUAAAAUGCAUCCUUUAUAUCAGUGAAGUUUUUGCUUCUAGGUAUAUUAUACUCACAUCGAAACACUCCAGGGAUUUUGUUUUCAGCCUGCAUAUACCACGUAUAUUUAUUAUCUGGAUAGAUAAAUUAGACGUAUACAUUUAAAGGAGUUUGCAUCAGCUGCUGCUAGGAAGUUUUUCUUGUGUUAGUUAAGAUCCUGUGAAACAACCCUUGACAUUUCACUAGCUGCACAGUUUGUAAUAAAAUCCAUUUUAGCCUGAGGUUAAAUCAUGACUGUGGUCCUCACAUCAUGGUGGGGGAUCCUGGUGGCCAGAUUAAAGGAAACUCCACAUUCUCAUUUCUGACUUCCCUACAACCUUGUAUUAAGACCUUAAUUGAAAAACUUAUUGCCUCUCUCACCAAAAUAUUUCAAAUUUUAAUAGUUUCCCCCAAUGAAAUUACAAGUACUAUUUUACUUUUUUCAGUGCCCUUGGAAUUUCGAGGCUGGAUGGGGGGCUUCAAUGUCUGACUCAUUAAGUGUUCUAUAUACAAAGCCCUACAUGGUCCCUAGAGCAUAGCAGGCAUUCAGUGAAUGAAAUGAAUGAAUGAAAAGCUAGAGUCACAUUUUAGUGACCUAACUGUAUAUUUUCAGAGUAAUGUAGUGCUUAAAAAAGGACAAUGAUAACACGUUUCUACAAAGAGAUGCAUGACAGAUAACACUUCUCAAGAAGAAGGAAUUUAGCUUCUGUCAUUUGAUCUAGGUUUUCAAUUACAGAAGCAUUGAGAAUUUCCUGUGGCUGGAUAAGGGCGAAUCUUUAAGGCAAGUUGAAGACCCAGGCUGCCCAUGUGGACAUCAAUACUCCCACAGAGCACUCUUCAUGAAGAAAAGUGUGGGCUUGCUGUCUUUUCAUCAAAACUCGUAGAAUUUGGCUGACUGCCUGGUUUAUCCCAGGACAUUAGUCAGCCCACAAAUCCCGCAUUUGUUUAUUCAGUCCAGAGCAAGUGAAUACUGCCAUUUUCUCAUCUCCUUUGUUGGCAACACUUUGUUAACCUGAAUUGGGUUCUCAACAUAAAAUGAAGUGACUAAUCUUUUGGGGGGUUCCCCCUCCCAGGUUCUUGUAUGAGCAACUAAAUCUACACACCACAAAGCCCCAUGCUGUCAUUUUUUCUCAUCCUGCCCCUUUAUUUUGAUGAUUCCACAUUGUAGUUCAUGAAACCAAUACCUUCUAGAGUGUGGCUGAACUGGCGCCAGCAUUAAGAAAAGGAGUUUCCAAACUUUUUAGUUUUGUGAGAAAAUGUUAGAGGAAGAGGGAGGUUAGGUUGACUAUUUAUACUUAUGUAAUCUUCUGUGAAUUUGCAGUAGUUAUCACCUUGUACUCUCAAAAGUUUUCUAGCUCUGAGUAUGUGAAUCUGAAAGUGCAGGAAGUAGGAAUCUUAGCACAAAACAACCAGUUUGGAUUAUCACACAAUUAAUAUGGGACGGAGCUGGAGGAUGGACCUGAACAGAAUGUAUAUUCUUUAUCACUAGGUUAUUUAUCUAUCUACAGAUGUCUAGAAAGACCUGGGCUUUUUUAGCAAACGUUUGAGAAUCUAGGUUUCUAAGUUUCCAUUGACCAUGAAAGAGUGAUUAGUUUUAGAAGACAGUUGGGGGCAACAUUGUGCAAGUCAGAAGAGGGGAUGAAGAAAAUCAUAAAGCUAAACAUGUUUGCCAUAGGCCCAGGCUGUUUUUCAGCAUGUUUCACCUAGCAGCUUGGCAGAUAAUUCCCAGUGAUCAUUAGGUCUGUGGAAAUUCUGUUUGGUUUAUAAAGUUUUGGCCCUGACUAUGUGUACCACUGAUAACUUGUUUUUCUCUCUCUUCCCUUUUCCUCCAACUCGUAGCCAGAGCUACCUUCCAGAUGACUUCUUUCUACCACUUUCUUUCUUCCCAGUGUAAGAGAAUGCAAGUAUAUGCUGAUGUUUGGAGCAAGAACAUUCAAAAAUUUUCUUAUUAACAUAACUUCUAAUGGAAAUACAGUAUACUACUAUGGUGCAUACAAAGAAGAAAUAGCAACAUAUAUUUGUUUUAGACCUGAUUGCUGUAUUUUAUUCCUUAGGUCCUCCUUGAUGUCUUGUAGACCGUCACUAGCUAAUUGUUACAGCCAUCGAAGGAAAAAAUAAGGAUUUUUACUUAGGACAUACGUAACAGAAAAAGAGAUGGUUUAGCAAAAAAGCACAGGCUUUGCAAUAAGCAGCCUUAAAUUAAAAAAAAAAAAGUUAACUCAUAACUAACUGUGUGACCUGGGAUAAGUUACUGAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1212 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1308.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 1106.3
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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