Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

CDKN2B-AS1:30

Sequence Length

581 nt

GC Content

0.3804

CAUGAAAUAAAUCAUCAUAAUAAAUCACUAUUUCAGAUAUUGAGAAACCACAGAAAGAGAGAAGUUAAAUAAUUUUCCUGUCAAAGACCACAUCAAUGAUGAAGCCAGAAUUUGAGCUCAUGUACUUAACCACUGGACUACCUGCCUGCCCUGUCGAGGAACAGCUAAGGUUGUCAUAGAGUCUUGACUGUGUAUAGAUAGUUGUUUGAAAAAUAUCUGCUGUGUUUAGGUCAUAGUCCAACCAAAGGAUUAAUUAACAUUUGCCUCUUUUUUCUCCUACAUCCAGUGUCCCUUUUGAUGAGAAGAAUAAGCCUCAUUCUGAUUCAACAGCAGAGAUCAAAGAAAAGACUUCUGUUUUCUGGCCACCAGAUAUAUGUUAUCUGUGCUUAAAGAAUUGAAAAACACACAUCAAAGGAGAAUUUUCUUGGAAAGAGAGGGUUCAAGCAUCACUGUUAGGUGUGCUGGAAUCCUUUCCCGAGUCAGUACUGCUUUCUAGAAGAAAACCGGGGAGAUCUAUUUGGAAUGUAUCUAACUCCAAAGAAACCAUCAGAGGUAACAGGUAGGAGAUAUGAAACGACCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-133.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -146.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 159.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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