Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

CDKN2B-AS1:35

Sequence Length

927 nt

GC Content

0.3517

GACGUAAGAUCAAAUGCAAUAGCAUGUCAAACAAUGUGUAACUCCAGUUAUACAAACAUUACUGUAUCUCAUUGGGGAUACGAAGCUCUACACACUUGAAGAUGGUGAAGGAAUAUAAAAAUUAUCUUACAGACAGCAAGUUGAACAUUGUGGGAUGCAUGAGCUAUUGAGGCCUUUGCAGCUUUCUGCUACAUGGAGGCUAGGGCCAGAGUCAAGAUUUAUGCUUUGCAGCACACUGGUCAGCUGUUUUUGCAAAUCAGAUUAAAUGAUUUUUAAAUGAGGCUGAGAGCAUGGGAGAUACUAAUGUGUGUUUCCUUGUGAGCUACUGCAUAAGUUAGGAAAUUGAAAUACAGAAAGAUGAAAAGUGAUUUGCCCAAGCAUAUAGAUCAAAGCUGUGGCAGAACCAGGACUGGAACCUAUAUCUCUCUACUAAUGGUUUUUUUAAAAAAAUAACCUUGUUUCAAAAAUAUUAAAAAGUCACAAGAAAGGUAAACAUGUGGAUAAACAAAAUGAAGAAAAUAAAAAUUAUCCAGUAAUAACAUAUUGGCAUAUGUCUUUCUGGUAUAUUUUCCUGUGUUGUCAUCAUUAUCAUCUCCAUCAUCAUUAUAUCCAUCAUUAUCAUCAUCAUCAUCAUCAUCAUCAUCAUUAUCAUCACCAUAGUGAACAUGUAAUGCUUACCUAGUGCCAGAUGCUGUCUAGGCAUUUUACAUGUGUUACUGGUAACUCAUGUAAUCCUCAUAACAACCUUAUAAGGUGGUUGCUAUUAUCCCCAUGUUACAUAUGAAGAGACAGAAGCAUAAAGAAGUUGCACCGCUGGUAAUUGGCUGGGAUUUGAACUUAAGCAGUCUAACCUUAGAGUAAUGAUUUUAACAACUAUGCUAUAUACAUACAAAUUUACAAAAUAAAACUGGGCUCAGACAAUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-204.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -222.7

Frequency: 0.0000

Diversity: 278.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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