Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
CDKN2B-AS1:41
Sequence Length
540 nt
GC Content
0.5685
AUCCGUCACCUGACACGGCCCUACCAGGAACAGCCGCGCUCCCGCGGAUUCUGGUGCUGCUCGCGUCCCCGCUCCCCUAUUCCCCUUAUUUUAUUCCUGGCUCCCCUCGUCGAAAGUCUUCCAUUCUUCAAACUAGAUUAUUUAAAAAUGAAAAAGGAAGAAAGGAAAGCGAGGUCAUCUCAUUGCUCUAUCCGCCAAUCAGGAGGCUGAAUGUCAGUUUUGAACUAAAAGCCGCUCCGCUCCUCUUCUAGAUUUGGAAAACAAGCGAAAUUAAACUAAACCGCUGCACGCCUCUGACGCGACAUCUGGACACGGCGCGGCGCUGGCGCUGCCGGAGCUGUCGACCCGGCCUGGCGCCGGACUAGCUGGGAGACAGGAAAAGCGGUCCUGUUUGGGAACAGUAAAAGCAGGGCAAGGAAAGGAAGGAGCGGCAGAAAGGAGGGGUGAGUCGAGGACACAGGGGCAGCCGGAGAAUGCGGAGGAGCCGGGUCCUGAGCGCGGUCUAAGCGAGGCUCGGCUCUCGUCCAGGAACUCGGACGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-197.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -207
Frequency: 0.0000
Diversity: 163.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...((((....((((..(((((((....(((((....))))).)))))))((.(((((.(.(((.((((((((((((............(((.(((((((((.(((....((.((((.((((((.......(((.......))).......)))))).)))).))....((..((((((.((((.(((........)))((((((...))))))...........((((((((..((((.((((.(((((.(........).)))))........(((..(((((((..((.((((....(((....))))))).))..)))).))))))..(((((..((((((.((((....).))))))))).)))))........(((((((((...........))))))))).)))).)))).)))))))).....)))).))))))..)).)))..))))).)))))))))))).)).))))).))).).)))))))))))...(((((((...)).))))).))))....))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((...((((((.,((({.,(((((((....(((((....))))).)))))))||,|{{((,(,(((.((((((((,,{{............((({((((((((((,({,...{(,((((.((((((....,..,{{,,,....}}))}...,,)))))}.)))}.}}{{,,.,..{{|{{{,{{{{.{((........}}|{(((({...)))))},,.........((((((((..((((.((((.{{(((,{......,,}.}}}}}........,(({{{{,((({..,,.{{{|...,(((,...||||||}.,,..|)))|)))}}}..(((((..((((({,((({....).))))))))).)))))....,}}}{((((((((...........))))))))).}))).)))).)))))))).....)))),))})))}})),))...))))).)))})).))))),)).|||||,|||.|,|}}}|||,|,,...}}})))))})))))},)),})))....))))...
Back