Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
CDKN2B-AS1:55
Sequence Length
707 nt
GC Content
0.4682
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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